Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AMBRA1Q9C0C7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AMBRA1Q9C0C7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AMBRA1Q9C0C7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AMBRA1Q9C0C7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AMBRA1Q9C0C7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMBRA1Q9C0C7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMBRA1Q9C0C7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMBRA1Q9C0C7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMBRA1Q9C0C7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMBRA1Q9C0C7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMBRA1Q9C0C7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AMBRA1Q9C0C7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AMBRA1Q9C0C7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AMBRA1Q9C0C7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AMBRA1Q9C0C7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AMBRA1Q9C0C7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AMBRA1Q9C0C7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
AMBRA1Q9C0C7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMBRA1Q9C0C7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AMBRA1Q9C0C7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMBRA1Q9C0C7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMBRA1Q9C0C7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMBRA1Q9C0C7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMBRA1Q9C0C7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMBRA1Q9C0C7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMBRA1Q9C0C7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMBRA1Q9C0C7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMBRA1Q9C0C7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMBRA1Q9C0C7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AMBRA1Q9C0C7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AMBRA1Q9C0C7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AMBRA1Q9C0C7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AMBRA1Q9C0C7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AMBRA1Q9C0C7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AMBRA1Q9C0C7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AMBRA1Q9C0C7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AMBRA1Q9C0C7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AMBRA1Q9C0C7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AMBRA1Q9C0C7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AMBRA1Q9C0C7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AMBRA1Q9C0C7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AMBRA1Q9C0C7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
AMBRA1Q9C0C7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AMBRA1Q9C0C7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AMBRA1Q9C0C7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AMBRA1Q9C0C7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMBRA1Q9C0C7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMBRA1Q9C0C7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
AMBRA1Q9C0C7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMBRA1Q9C0C7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMBRA1Q9C0C7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AMBRA1Q9C0C7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMBRA1Q9C0C7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMBRA1Q9C0C7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMBRA1Q9C0C7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMBRA1Q9C0C7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AMBRA1Q9C0C7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AMBRA1Q9C0C7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AMBRA1Q9C0C7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AMBRA1Q9C0C7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AMBRA1Q9C0C7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AMBRA1Q9C0C7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AMBRA1Q9C0C7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AMBRA1Q9C0C7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMBRA1Q9C0C7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMBRA1Q9C0C7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMBRA1Q9C0C7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AMBRA1Q9C0C7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMBRA1Q9C0C7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMBRA1Q9C0C7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AMBRA1Q9C0C7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMBRA1Q9C0C7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMBRA1Q9C0C7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMBRA1Q9C0C7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMBRA1Q9C0C7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMBRA1Q9C0C7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMBRA1Q9C0C7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMBRA1Q9C0C7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMBRA1Q9C0C7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AMBRA1Q9C0C7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMBRA1Q9C0C7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMBRA1Q9C0C7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMBRA1Q9C0C7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMBRA1Q9C0C7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMBRA1Q9C0C7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AMBRA1Q9C0C7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMBRA1Q9C0C7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMBRA1Q9C0C7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMBRA1Q9C0C7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMBRA1Q9C0C7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMBRA1Q9C0C7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
AMBRA1Q9C0C7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AMBRA1Q9C0C7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AMBRA1Q9C0C7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AMBRA1Q9C0C7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms