Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CIPCQ9C0C6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CIPCQ9C0C6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CIPCQ9C0C6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CIPCQ9C0C6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CIPCQ9C0C6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CIPCQ9C0C6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CIPCQ9C0C6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CIPCQ9C0C6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CIPCQ9C0C6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CIPCQ9C0C6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CIPCQ9C0C6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CIPCQ9C0C6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CIPCQ9C0C6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CIPCQ9C0C6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CIPCQ9C0C6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CIPCQ9C0C6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CIPCQ9C0C6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CIPCQ9C0C6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CIPCQ9C0C6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CIPCQ9C0C6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CIPCQ9C0C6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CIPCQ9C0C6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CIPCQ9C0C6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CIPCQ9C0C6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CIPCQ9C0C6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CIPCQ9C0C6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CIPCQ9C0C6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CIPCQ9C0C6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CIPCQ9C0C6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CIPCQ9C0C6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CIPCQ9C0C6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CIPCQ9C0C6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CIPCQ9C0C6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CIPCQ9C0C6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CIPCQ9C0C6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CIPCQ9C0C6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CIPCQ9C0C6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CIPCQ9C0C6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CIPCQ9C0C6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CIPCQ9C0C6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CIPCQ9C0C6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CIPCQ9C0C6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CIPCQ9C0C6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CIPCQ9C0C6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CIPCQ9C0C6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CIPCQ9C0C6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CIPCQ9C0C6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CIPCQ9C0C6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CIPCQ9C0C6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CIPCQ9C0C6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CIPCQ9C0C6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CIPCQ9C0C6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CIPCQ9C0C6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CIPCQ9C0C6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CIPCQ9C0C6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CIPCQ9C0C6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CIPCQ9C0C6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CIPCQ9C0C6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CIPCQ9C0C6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CIPCQ9C0C6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CIPCQ9C0C6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CIPCQ9C0C6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CIPCQ9C0C6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CIPCQ9C0C6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CIPCQ9C0C6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CIPCQ9C0C6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CIPCQ9C0C6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CIPCQ9C0C6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CIPCQ9C0C6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms