Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD3

MRPL4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4Q9BYD3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRPL4Q9BYD3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MRPL4Q9BYD3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRPL4Q9BYD3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRPL4Q9BYD3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRPL4Q9BYD3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRPL4Q9BYD3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MRPL4Q9BYD3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRPL4Q9BYD3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRPL4Q9BYD3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRPL4Q9BYD3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRPL4Q9BYD3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRPL4Q9BYD3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRPL4Q9BYD3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRPL4Q9BYD3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRPL4Q9BYD3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRPL4Q9BYD3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MRPL4Q9BYD3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRPL4Q9BYD3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRPL4Q9BYD3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRPL4Q9BYD3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRPL4Q9BYD3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MRPL4Q9BYD3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRPL4Q9BYD3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRPL4Q9BYD3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MRPL4Q9BYD3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MRPL4Q9BYD3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MRPL4Q9BYD3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
MRPL4Q9BYD3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
MRPL4Q9BYD3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MRPL4Q9BYD3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MRPL4Q9BYD3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MRPL4Q9BYD3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MRPL4Q9BYD3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MRPL4Q9BYD3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MRPL4Q9BYD3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MRPL4Q9BYD3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MRPL4Q9BYD3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MRPL4Q9BYD3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MRPL4Q9BYD3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MRPL4Q9BYD3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MRPL4Q9BYD3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MRPL4Q9BYD3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MRPL4Q9BYD3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MRPL4Q9BYD3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MRPL4Q9BYD3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MRPL4Q9BYD3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MRPL4Q9BYD3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MRPL4Q9BYD3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPL4Q9BYD3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPL4Q9BYD3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MRPL4Q9BYD3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MRPL4Q9BYD3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MRPL4Q9BYD3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MRPL4Q9BYD3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MRPL4Q9BYD3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MRPL4Q9BYD3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MRPL4Q9BYD3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MRPL4Q9BYD3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MRPL4Q9BYD3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MRPL4Q9BYD3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPL4Q9BYD3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPL4Q9BYD3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MRPL4Q9BYD3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MRPL4Q9BYD3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MRPL4Q9BYD3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MRPL4Q9BYD3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MRPL4Q9BYD3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MRPL4Q9BYD3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MRPL4Q9BYD3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MRPL4Q9BYD3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MRPL4Q9BYD3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MRPL4Q9BYD3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MRPL4Q9BYD3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MRPL4Q9BYD3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPL4Q9BYD3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPL4Q9BYD3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MRPL4Q9BYD3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MRPL4Q9BYD3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MRPL4Q9BYD3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MRPL4Q9BYD3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MRPL4Q9BYD3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MRPL4Q9BYD3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MRPL4Q9BYD3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MRPL4Q9BYD3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MRPL4Q9BYD3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MRPL4Q9BYD3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MRPL4Q9BYD3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MRPL4Q9BYD3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MRPL4Q9BYD3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MRPL4Q9BYD3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MRPL4Q9BYD3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MRPL4Q9BYD3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MRPL4Q9BYD3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MRPL4Q9BYD3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MRPL4Q9BYD3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MRPL4Q9BYD3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MRPL4Q9BYD3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MRPL4Q9BYD3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MRPL4Q9BYD3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms