Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTT6

LRRC1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC1Q9BTT6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC1Q9BTT6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC1Q9BTT6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC1Q9BTT6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC1Q9BTT6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC1Q9BTT6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC1Q9BTT6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC1Q9BTT6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC1Q9BTT6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC1Q9BTT6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC1Q9BTT6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC1Q9BTT6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC1Q9BTT6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC1Q9BTT6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC1Q9BTT6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC1Q9BTT6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC1Q9BTT6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC1Q9BTT6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC1Q9BTT6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC1Q9BTT6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC1Q9BTT6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC1Q9BTT6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC1Q9BTT6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC1Q9BTT6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC1Q9BTT6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC1Q9BTT6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC1Q9BTT6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC1Q9BTT6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC1Q9BTT6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC1Q9BTT6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC1Q9BTT6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC1Q9BTT6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC1Q9BTT6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC1Q9BTT6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC1Q9BTT6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC1Q9BTT6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC1Q9BTT6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC1Q9BTT6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC1Q9BTT6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC1Q9BTT6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC1Q9BTT6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC1Q9BTT6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC1Q9BTT6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC1Q9BTT6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRC1Q9BTT6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC1Q9BTT6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC1Q9BTT6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC1Q9BTT6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC1Q9BTT6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC1Q9BTT6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC1Q9BTT6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC1Q9BTT6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC1Q9BTT6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC1Q9BTT6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC1Q9BTT6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC1Q9BTT6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC1Q9BTT6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC1Q9BTT6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC1Q9BTT6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC1Q9BTT6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC1Q9BTT6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC1Q9BTT6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC1Q9BTT6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC1Q9BTT6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC1Q9BTT6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC1Q9BTT6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC1Q9BTT6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC1Q9BTT6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC1Q9BTT6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC1Q9BTT6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC1Q9BTT6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC1Q9BTT6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC1Q9BTT6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC1Q9BTT6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC1Q9BTT6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC1Q9BTT6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC1Q9BTT6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC1Q9BTT6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC1Q9BTT6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC1Q9BTT6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC1Q9BTT6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC1Q9BTT6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC1Q9BTT6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC1Q9BTT6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC1Q9BTT6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC1Q9BTT6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC1Q9BTT6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC1Q9BTT6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC1Q9BTT6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC1Q9BTT6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC1Q9BTT6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC1Q9BTT6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC1Q9BTT6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC1Q9BTT6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC1Q9BTT6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC1Q9BTT6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC1Q9BTT6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC1Q9BTT6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC1Q9BTT6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC1Q9BTT6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.6 ms