Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF8Q9BRL6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF8Q9BRL6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF8Q9BRL6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF8Q9BRL6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF8Q9BRL6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF8Q9BRL6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF8Q9BRL6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF8Q9BRL6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF8Q9BRL6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF8Q9BRL6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF8Q9BRL6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF8Q9BRL6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF8Q9BRL6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF8Q9BRL6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF8Q9BRL6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF8Q9BRL6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF8Q9BRL6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF8Q9BRL6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF8Q9BRL6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF8Q9BRL6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF8Q9BRL6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF8Q9BRL6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF8Q9BRL6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRSF8Q9BRL6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRSF8Q9BRL6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SRSF8Q9BRL6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF8Q9BRL6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF8Q9BRL6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF8Q9BRL6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF8Q9BRL6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF8Q9BRL6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF8Q9BRL6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms