Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX7

C7orf25, UPF0415 protein C7orf25, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf25Q9BPX7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
C7orf25Q9BPX7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C7orf25Q9BPX7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C7orf25Q9BPX7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
C7orf25Q9BPX7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
C7orf25Q9BPX7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C7orf25Q9BPX7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C7orf25Q9BPX7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C7orf25Q9BPX7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C7orf25Q9BPX7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
C7orf25Q9BPX7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C7orf25Q9BPX7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
C7orf25Q9BPX7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C7orf25Q9BPX7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C7orf25Q9BPX7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C7orf25Q9BPX7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C7orf25Q9BPX7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C7orf25Q9BPX7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C7orf25Q9BPX7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C7orf25Q9BPX7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C7orf25Q9BPX7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C7orf25Q9BPX7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C7orf25Q9BPX7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C7orf25Q9BPX7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C7orf25Q9BPX7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C7orf25Q9BPX7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C7orf25Q9BPX7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
C7orf25Q9BPX7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C7orf25Q9BPX7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C7orf25Q9BPX7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C7orf25Q9BPX7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C7orf25Q9BPX7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C7orf25Q9BPX7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C7orf25Q9BPX7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C7orf25Q9BPX7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C7orf25Q9BPX7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C7orf25Q9BPX7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C7orf25Q9BPX7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C7orf25Q9BPX7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C7orf25Q9BPX7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C7orf25Q9BPX7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C7orf25Q9BPX7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C7orf25Q9BPX7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C7orf25Q9BPX7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
C7orf25Q9BPX7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C7orf25Q9BPX7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C7orf25Q9BPX7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C7orf25Q9BPX7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C7orf25Q9BPX7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C7orf25Q9BPX7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C7orf25Q9BPX7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C7orf25Q9BPX7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C7orf25Q9BPX7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C7orf25Q9BPX7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C7orf25Q9BPX7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C7orf25Q9BPX7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C7orf25Q9BPX7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C7orf25Q9BPX7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C7orf25Q9BPX7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C7orf25Q9BPX7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C7orf25Q9BPX7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
C7orf25Q9BPX7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
C7orf25Q9BPX7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C7orf25Q9BPX7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C7orf25Q9BPX7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C7orf25Q9BPX7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
C7orf25Q9BPX7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C7orf25Q9BPX7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C7orf25Q9BPX7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
C7orf25Q9BPX7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
C7orf25Q9BPX7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C7orf25Q9BPX7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C7orf25Q9BPX7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C7orf25Q9BPX7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C7orf25Q9BPX7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C7orf25Q9BPX7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C7orf25Q9BPX7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C7orf25Q9BPX7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C7orf25Q9BPX7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
C7orf25Q9BPX7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
C7orf25Q9BPX7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
C7orf25Q9BPX7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
C7orf25Q9BPX7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C7orf25Q9BPX7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C7orf25Q9BPX7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C7orf25Q9BPX7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C7orf25Q9BPX7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C7orf25Q9BPX7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
C7orf25Q9BPX7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C7orf25Q9BPX7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C7orf25Q9BPX7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C7orf25Q9BPX7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C7orf25Q9BPX7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C7orf25Q9BPX7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C7orf25Q9BPX7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C7orf25Q9BPX7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C7orf25Q9BPX7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C7orf25Q9BPX7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C7orf25Q9BPX7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C7orf25Q9BPX7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms