Protein–RNA interactions for Protein: Q99941

ATF6B, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6BQ99941 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF6BQ99941 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF6BQ99941 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF6BQ99941 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF6BQ99941 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF6BQ99941 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF6BQ99941 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF6BQ99941 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF6BQ99941 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATF6BQ99941 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF6BQ99941 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF6BQ99941 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF6BQ99941 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF6BQ99941 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF6BQ99941 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF6BQ99941 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF6BQ99941 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF6BQ99941 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF6BQ99941 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF6BQ99941 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF6BQ99941 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF6BQ99941 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF6BQ99941 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF6BQ99941 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF6BQ99941 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF6BQ99941 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF6BQ99941 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF6BQ99941 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF6BQ99941 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF6BQ99941 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF6BQ99941 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF6BQ99941 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF6BQ99941 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF6BQ99941 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF6BQ99941 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF6BQ99941 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF6BQ99941 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF6BQ99941 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF6BQ99941 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF6BQ99941 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF6BQ99941 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF6BQ99941 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF6BQ99941 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF6BQ99941 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF6BQ99941 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF6BQ99941 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF6BQ99941 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF6BQ99941 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF6BQ99941 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF6BQ99941 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF6BQ99941 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF6BQ99941 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF6BQ99941 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF6BQ99941 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF6BQ99941 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF6BQ99941 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF6BQ99941 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF6BQ99941 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATF6BQ99941 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATF6BQ99941 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms