Protein–RNA interactions for Protein: Q99684

GFI1, Zinc finger protein Gfi-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1Q99684 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GFI1Q99684 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GFI1Q99684 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GFI1Q99684 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFI1Q99684 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFI1Q99684 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFI1Q99684 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFI1Q99684 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFI1Q99684 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFI1Q99684 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFI1Q99684 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFI1Q99684 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFI1Q99684 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFI1Q99684 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFI1Q99684 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFI1Q99684 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFI1Q99684 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GFI1Q99684 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFI1Q99684 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFI1Q99684 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFI1Q99684 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFI1Q99684 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFI1Q99684 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFI1Q99684 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFI1Q99684 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFI1Q99684 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GFI1Q99684 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFI1Q99684 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFI1Q99684 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFI1Q99684 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFI1Q99684 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFI1Q99684 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFI1Q99684 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFI1Q99684 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFI1Q99684 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFI1Q99684 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFI1Q99684 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFI1Q99684 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFI1Q99684 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFI1Q99684 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GFI1Q99684 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFI1Q99684 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFI1Q99684 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFI1Q99684 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFI1Q99684 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GFI1Q99684 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFI1Q99684 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFI1Q99684 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GFI1Q99684 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFI1Q99684 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFI1Q99684 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFI1Q99684 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFI1Q99684 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFI1Q99684 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFI1Q99684 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFI1Q99684 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFI1Q99684 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFI1Q99684 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFI1Q99684 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFI1Q99684 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFI1Q99684 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFI1Q99684 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFI1Q99684 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFI1Q99684 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFI1Q99684 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFI1Q99684 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFI1Q99684 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFI1Q99684 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFI1Q99684 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFI1Q99684 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFI1Q99684 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFI1Q99684 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFI1Q99684 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFI1Q99684 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFI1Q99684 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFI1Q99684 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFI1Q99684 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFI1Q99684 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFI1Q99684 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFI1Q99684 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFI1Q99684 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFI1Q99684 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFI1Q99684 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFI1Q99684 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFI1Q99684 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFI1Q99684 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFI1Q99684 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFI1Q99684 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GFI1Q99684 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFI1Q99684 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFI1Q99684 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFI1Q99684 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFI1Q99684 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 285.7 ms