Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q40

CDK15, Cyclin-dependent kinase 15, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK15Q96Q40 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK15Q96Q40 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK15Q96Q40 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK15Q96Q40 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK15Q96Q40 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK15Q96Q40 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK15Q96Q40 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK15Q96Q40 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK15Q96Q40 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK15Q96Q40 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK15Q96Q40 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK15Q96Q40 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK15Q96Q40 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK15Q96Q40 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK15Q96Q40 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK15Q96Q40 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK15Q96Q40 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK15Q96Q40 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK15Q96Q40 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK15Q96Q40 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK15Q96Q40 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK15Q96Q40 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK15Q96Q40 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK15Q96Q40 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK15Q96Q40 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK15Q96Q40 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK15Q96Q40 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK15Q96Q40 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK15Q96Q40 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK15Q96Q40 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK15Q96Q40 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK15Q96Q40 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK15Q96Q40 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK15Q96Q40 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK15Q96Q40 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK15Q96Q40 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK15Q96Q40 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK15Q96Q40 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK15Q96Q40 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK15Q96Q40 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK15Q96Q40 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK15Q96Q40 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK15Q96Q40 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK15Q96Q40 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK15Q96Q40 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK15Q96Q40 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK15Q96Q40 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK15Q96Q40 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK15Q96Q40 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK15Q96Q40 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK15Q96Q40 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK15Q96Q40 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK15Q96Q40 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK15Q96Q40 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK15Q96Q40 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK15Q96Q40 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK15Q96Q40 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK15Q96Q40 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK15Q96Q40 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK15Q96Q40 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK15Q96Q40 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK15Q96Q40 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK15Q96Q40 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK15Q96Q40 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK15Q96Q40 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK15Q96Q40 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK15Q96Q40 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK15Q96Q40 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK15Q96Q40 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms