Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF488Q96MN9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF488Q96MN9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF488Q96MN9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF488Q96MN9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF488Q96MN9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF488Q96MN9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF488Q96MN9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF488Q96MN9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF488Q96MN9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF488Q96MN9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF488Q96MN9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF488Q96MN9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF488Q96MN9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF488Q96MN9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF488Q96MN9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF488Q96MN9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF488Q96MN9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF488Q96MN9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF488Q96MN9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF488Q96MN9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF488Q96MN9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF488Q96MN9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF488Q96MN9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF488Q96MN9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF488Q96MN9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF488Q96MN9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF488Q96MN9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF488Q96MN9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF488Q96MN9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF488Q96MN9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF488Q96MN9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF488Q96MN9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF488Q96MN9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF488Q96MN9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF488Q96MN9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF488Q96MN9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF488Q96MN9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF488Q96MN9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF488Q96MN9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF488Q96MN9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF488Q96MN9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF488Q96MN9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF488Q96MN9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF488Q96MN9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF488Q96MN9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF488Q96MN9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF488Q96MN9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF488Q96MN9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF488Q96MN9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF488Q96MN9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF488Q96MN9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF488Q96MN9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF488Q96MN9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF488Q96MN9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF488Q96MN9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF488Q96MN9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF488Q96MN9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF488Q96MN9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF488Q96MN9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF488Q96MN9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF488Q96MN9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF488Q96MN9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF488Q96MN9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF488Q96MN9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF488Q96MN9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF488Q96MN9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF488Q96MN9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF488Q96MN9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF488Q96MN9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms