Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD2

C12orf66, KICSTOR complex protein C12orf66, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf66Q96MD2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
C12orf66Q96MD2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
C12orf66Q96MD2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
C12orf66Q96MD2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
C12orf66Q96MD2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C12orf66Q96MD2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C12orf66Q96MD2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C12orf66Q96MD2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C12orf66Q96MD2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C12orf66Q96MD2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C12orf66Q96MD2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C12orf66Q96MD2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf66Q96MD2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf66Q96MD2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf66Q96MD2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf66Q96MD2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf66Q96MD2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf66Q96MD2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf66Q96MD2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf66Q96MD2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C12orf66Q96MD2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C12orf66Q96MD2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
C12orf66Q96MD2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
C12orf66Q96MD2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C12orf66Q96MD2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C12orf66Q96MD2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C12orf66Q96MD2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
C12orf66Q96MD2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C12orf66Q96MD2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf66Q96MD2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf66Q96MD2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf66Q96MD2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf66Q96MD2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf66Q96MD2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf66Q96MD2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf66Q96MD2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C12orf66Q96MD2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C12orf66Q96MD2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C12orf66Q96MD2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C12orf66Q96MD2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C12orf66Q96MD2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C12orf66Q96MD2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C12orf66Q96MD2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C12orf66Q96MD2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C12orf66Q96MD2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C12orf66Q96MD2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C12orf66Q96MD2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C12orf66Q96MD2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C12orf66Q96MD2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C12orf66Q96MD2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C12orf66Q96MD2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C12orf66Q96MD2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C12orf66Q96MD2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C12orf66Q96MD2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C12orf66Q96MD2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C12orf66Q96MD2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C12orf66Q96MD2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C12orf66Q96MD2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C12orf66Q96MD2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C12orf66Q96MD2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C12orf66Q96MD2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C12orf66Q96MD2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C12orf66Q96MD2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C12orf66Q96MD2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C12orf66Q96MD2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf66Q96MD2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf66Q96MD2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf66Q96MD2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf66Q96MD2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
C12orf66Q96MD2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf66Q96MD2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf66Q96MD2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf66Q96MD2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf66Q96MD2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf66Q96MD2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf66Q96MD2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf66Q96MD2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf66Q96MD2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf66Q96MD2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf66Q96MD2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf66Q96MD2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf66Q96MD2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf66Q96MD2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf66Q96MD2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf66Q96MD2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf66Q96MD2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf66Q96MD2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf66Q96MD2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf66Q96MD2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf66Q96MD2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf66Q96MD2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf66Q96MD2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf66Q96MD2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf66Q96MD2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf66Q96MD2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf66Q96MD2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf66Q96MD2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf66Q96MD2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C12orf66Q96MD2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C12orf66Q96MD2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms