Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFT74Q96LB3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFT74Q96LB3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFT74Q96LB3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
IFT74Q96LB3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
IFT74Q96LB3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
IFT74Q96LB3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
IFT74Q96LB3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
IFT74Q96LB3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
IFT74Q96LB3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
IFT74Q96LB3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
IFT74Q96LB3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
IFT74Q96LB3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFT74Q96LB3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFT74Q96LB3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFT74Q96LB3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFT74Q96LB3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFT74Q96LB3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFT74Q96LB3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFT74Q96LB3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFT74Q96LB3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFT74Q96LB3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFT74Q96LB3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFT74Q96LB3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFT74Q96LB3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFT74Q96LB3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
IFT74Q96LB3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFT74Q96LB3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFT74Q96LB3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFT74Q96LB3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFT74Q96LB3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFT74Q96LB3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFT74Q96LB3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFT74Q96LB3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
IFT74Q96LB3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
IFT74Q96LB3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFT74Q96LB3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFT74Q96LB3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFT74Q96LB3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFT74Q96LB3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFT74Q96LB3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFT74Q96LB3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT74Q96LB3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT74Q96LB3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT74Q96LB3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT74Q96LB3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT74Q96LB3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT74Q96LB3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFT74Q96LB3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFT74Q96LB3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFT74Q96LB3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT74Q96LB3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT74Q96LB3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT74Q96LB3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT74Q96LB3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
IFT74Q96LB3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFT74Q96LB3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFT74Q96LB3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFT74Q96LB3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFT74Q96LB3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFT74Q96LB3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFT74Q96LB3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFT74Q96LB3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFT74Q96LB3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT74Q96LB3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT74Q96LB3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFT74Q96LB3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT74Q96LB3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT74Q96LB3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT74Q96LB3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT74Q96LB3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT74Q96LB3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT74Q96LB3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT74Q96LB3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT74Q96LB3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFT74Q96LB3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFT74Q96LB3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFT74Q96LB3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFT74Q96LB3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFT74Q96LB3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFT74Q96LB3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFT74Q96LB3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
IFT74Q96LB3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFT74Q96LB3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT74Q96LB3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFT74Q96LB3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IFT74Q96LB3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
IFT74Q96LB3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFT74Q96LB3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFT74Q96LB3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFT74Q96LB3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT74Q96LB3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT74Q96LB3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT74Q96LB3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT74Q96LB3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFT74Q96LB3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFT74Q96LB3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFT74Q96LB3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFT74Q96LB3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT74Q96LB3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms