Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TNIP3Q96KP6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TNIP3Q96KP6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TNIP3Q96KP6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TNIP3Q96KP6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNIP3Q96KP6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNIP3Q96KP6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNIP3Q96KP6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNIP3Q96KP6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNIP3Q96KP6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNIP3Q96KP6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNIP3Q96KP6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNIP3Q96KP6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNIP3Q96KP6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNIP3Q96KP6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNIP3Q96KP6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNIP3Q96KP6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNIP3Q96KP6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNIP3Q96KP6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TNIP3Q96KP6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNIP3Q96KP6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNIP3Q96KP6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNIP3Q96KP6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNIP3Q96KP6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNIP3Q96KP6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNIP3Q96KP6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TNIP3Q96KP6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TNIP3Q96KP6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNIP3Q96KP6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNIP3Q96KP6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNIP3Q96KP6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNIP3Q96KP6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNIP3Q96KP6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNIP3Q96KP6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNIP3Q96KP6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNIP3Q96KP6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNIP3Q96KP6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNIP3Q96KP6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNIP3Q96KP6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TNIP3Q96KP6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNIP3Q96KP6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNIP3Q96KP6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNIP3Q96KP6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNIP3Q96KP6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNIP3Q96KP6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNIP3Q96KP6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNIP3Q96KP6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNIP3Q96KP6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNIP3Q96KP6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNIP3Q96KP6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TNIP3Q96KP6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNIP3Q96KP6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNIP3Q96KP6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNIP3Q96KP6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNIP3Q96KP6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNIP3Q96KP6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNIP3Q96KP6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TNIP3Q96KP6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNIP3Q96KP6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNIP3Q96KP6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TNIP3Q96KP6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TNIP3Q96KP6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNIP3Q96KP6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNIP3Q96KP6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNIP3Q96KP6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNIP3Q96KP6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNIP3Q96KP6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TNIP3Q96KP6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNIP3Q96KP6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNIP3Q96KP6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNIP3Q96KP6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TNIP3Q96KP6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNIP3Q96KP6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNIP3Q96KP6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNIP3Q96KP6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TNIP3Q96KP6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TNIP3Q96KP6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNIP3Q96KP6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNIP3Q96KP6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNIP3Q96KP6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNIP3Q96KP6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNIP3Q96KP6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNIP3Q96KP6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNIP3Q96KP6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNIP3Q96KP6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNIP3Q96KP6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNIP3Q96KP6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNIP3Q96KP6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNIP3Q96KP6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNIP3Q96KP6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNIP3Q96KP6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNIP3Q96KP6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNIP3Q96KP6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNIP3Q96KP6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNIP3Q96KP6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNIP3Q96KP6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNIP3Q96KP6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNIP3Q96KP6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNIP3Q96KP6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNIP3Q96KP6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms