Protein–RNA interactions for Protein: Q96H15

TIMD4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMD4Q96H15 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMD4Q96H15 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMD4Q96H15 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMD4Q96H15 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMD4Q96H15 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMD4Q96H15 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMD4Q96H15 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMD4Q96H15 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMD4Q96H15 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMD4Q96H15 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMD4Q96H15 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMD4Q96H15 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMD4Q96H15 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMD4Q96H15 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMD4Q96H15 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMD4Q96H15 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMD4Q96H15 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMD4Q96H15 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIMD4Q96H15 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMD4Q96H15 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMD4Q96H15 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMD4Q96H15 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMD4Q96H15 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMD4Q96H15 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMD4Q96H15 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMD4Q96H15 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMD4Q96H15 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMD4Q96H15 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMD4Q96H15 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMD4Q96H15 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMD4Q96H15 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMD4Q96H15 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMD4Q96H15 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMD4Q96H15 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMD4Q96H15 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMD4Q96H15 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMD4Q96H15 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMD4Q96H15 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMD4Q96H15 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMD4Q96H15 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMD4Q96H15 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMD4Q96H15 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMD4Q96H15 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMD4Q96H15 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMD4Q96H15 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMD4Q96H15 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMD4Q96H15 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMD4Q96H15 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMD4Q96H15 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMD4Q96H15 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMD4Q96H15 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMD4Q96H15 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMD4Q96H15 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TIMD4Q96H15 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMD4Q96H15 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMD4Q96H15 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMD4Q96H15 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMD4Q96H15 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMD4Q96H15 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMD4Q96H15 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMD4Q96H15 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMD4Q96H15 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms