Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNFT2Q96EX2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNFT2Q96EX2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNFT2Q96EX2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNFT2Q96EX2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNFT2Q96EX2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNFT2Q96EX2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RNFT2Q96EX2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNFT2Q96EX2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNFT2Q96EX2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNFT2Q96EX2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNFT2Q96EX2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNFT2Q96EX2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RNFT2Q96EX2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNFT2Q96EX2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RNFT2Q96EX2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNFT2Q96EX2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNFT2Q96EX2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNFT2Q96EX2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNFT2Q96EX2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNFT2Q96EX2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNFT2Q96EX2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNFT2Q96EX2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNFT2Q96EX2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNFT2Q96EX2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RNFT2Q96EX2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNFT2Q96EX2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNFT2Q96EX2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNFT2Q96EX2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNFT2Q96EX2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNFT2Q96EX2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNFT2Q96EX2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNFT2Q96EX2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNFT2Q96EX2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms