Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VOPP1Q96AW1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VOPP1Q96AW1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VOPP1Q96AW1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VOPP1Q96AW1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VOPP1Q96AW1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VOPP1Q96AW1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VOPP1Q96AW1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VOPP1Q96AW1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VOPP1Q96AW1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VOPP1Q96AW1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VOPP1Q96AW1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VOPP1Q96AW1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VOPP1Q96AW1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VOPP1Q96AW1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VOPP1Q96AW1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VOPP1Q96AW1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VOPP1Q96AW1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
VOPP1Q96AW1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VOPP1Q96AW1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VOPP1Q96AW1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VOPP1Q96AW1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VOPP1Q96AW1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VOPP1Q96AW1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VOPP1Q96AW1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VOPP1Q96AW1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
VOPP1Q96AW1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VOPP1Q96AW1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VOPP1Q96AW1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VOPP1Q96AW1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VOPP1Q96AW1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VOPP1Q96AW1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VOPP1Q96AW1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VOPP1Q96AW1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VOPP1Q96AW1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VOPP1Q96AW1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VOPP1Q96AW1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VOPP1Q96AW1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VOPP1Q96AW1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VOPP1Q96AW1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
VOPP1Q96AW1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
VOPP1Q96AW1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VOPP1Q96AW1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VOPP1Q96AW1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VOPP1Q96AW1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VOPP1Q96AW1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VOPP1Q96AW1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VOPP1Q96AW1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VOPP1Q96AW1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VOPP1Q96AW1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VOPP1Q96AW1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VOPP1Q96AW1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VOPP1Q96AW1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
VOPP1Q96AW1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VOPP1Q96AW1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VOPP1Q96AW1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VOPP1Q96AW1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VOPP1Q96AW1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VOPP1Q96AW1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VOPP1Q96AW1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VOPP1Q96AW1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VOPP1Q96AW1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VOPP1Q96AW1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VOPP1Q96AW1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VOPP1Q96AW1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VOPP1Q96AW1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VOPP1Q96AW1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
VOPP1Q96AW1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VOPP1Q96AW1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VOPP1Q96AW1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VOPP1Q96AW1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VOPP1Q96AW1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VOPP1Q96AW1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VOPP1Q96AW1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VOPP1Q96AW1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VOPP1Q96AW1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VOPP1Q96AW1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VOPP1Q96AW1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VOPP1Q96AW1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VOPP1Q96AW1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VOPP1Q96AW1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VOPP1Q96AW1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VOPP1Q96AW1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VOPP1Q96AW1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VOPP1Q96AW1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VOPP1Q96AW1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VOPP1Q96AW1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VOPP1Q96AW1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VOPP1Q96AW1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VOPP1Q96AW1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VOPP1Q96AW1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VOPP1Q96AW1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VOPP1Q96AW1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VOPP1Q96AW1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms