Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2A3Q93084 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2A3Q93084 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2A3Q93084 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2A3Q93084 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2A3Q93084 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2A3Q93084 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2A3Q93084 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2A3Q93084 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2A3Q93084 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2A3Q93084 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2A3Q93084 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2A3Q93084 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2A3Q93084 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2A3Q93084 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2A3Q93084 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2A3Q93084 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2A3Q93084 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2A3Q93084 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2A3Q93084 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2A3Q93084 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2A3Q93084 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2A3Q93084 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2A3Q93084 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2A3Q93084 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2A3Q93084 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2A3Q93084 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2A3Q93084 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2A3Q93084 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2A3Q93084 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2A3Q93084 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2A3Q93084 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2A3Q93084 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2A3Q93084 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2A3Q93084 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2A3Q93084 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2A3Q93084 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2A3Q93084 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2A3Q93084 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2A3Q93084 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2A3Q93084 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2A3Q93084 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2A3Q93084 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2A3Q93084 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2A3Q93084 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2A3Q93084 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2A3Q93084 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2A3Q93084 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2A3Q93084 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2A3Q93084 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2A3Q93084 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP2A3Q93084 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2A3Q93084 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2A3Q93084 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2A3Q93084 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2A3Q93084 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2A3Q93084 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2A3Q93084 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2A3Q93084 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2A3Q93084 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2A3Q93084 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2A3Q93084 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2A3Q93084 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2A3Q93084 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2A3Q93084 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2A3Q93084 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2A3Q93084 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2A3Q93084 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2A3Q93084 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2A3Q93084 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2A3Q93084 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2A3Q93084 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2A3Q93084 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2A3Q93084 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2A3Q93084 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2A3Q93084 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2A3Q93084 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2A3Q93084 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2A3Q93084 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2A3Q93084 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2A3Q93084 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP2A3Q93084 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP2A3Q93084 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP2A3Q93084 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP2A3Q93084 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2A3Q93084 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2A3Q93084 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2A3Q93084 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2A3Q93084 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2A3Q93084 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2A3Q93084 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2A3Q93084 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2A3Q93084 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2A3Q93084 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2A3Q93084 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2A3Q93084 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2A3Q93084 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2A3Q93084 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2A3Q93084 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP2A3Q93084 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms