Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PROX1Q92786 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PROX1Q92786 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PROX1Q92786 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PROX1Q92786 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROX1Q92786 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROX1Q92786 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROX1Q92786 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROX1Q92786 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PROX1Q92786 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PROX1Q92786 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PROX1Q92786 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PROX1Q92786 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PROX1Q92786 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PROX1Q92786 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PROX1Q92786 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PROX1Q92786 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PROX1Q92786 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PROX1Q92786 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PROX1Q92786 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PROX1Q92786 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PROX1Q92786 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PROX1Q92786 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PROX1Q92786 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PROX1Q92786 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PROX1Q92786 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PROX1Q92786 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PROX1Q92786 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PROX1Q92786 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PROX1Q92786 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PROX1Q92786 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PROX1Q92786 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PROX1Q92786 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PROX1Q92786 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PROX1Q92786 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PROX1Q92786 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PROX1Q92786 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PROX1Q92786 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PROX1Q92786 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PROX1Q92786 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PROX1Q92786 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PROX1Q92786 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PROX1Q92786 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PROX1Q92786 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PROX1Q92786 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PROX1Q92786 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PROX1Q92786 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PROX1Q92786 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PROX1Q92786 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PROX1Q92786 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PROX1Q92786 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PROX1Q92786 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PROX1Q92786 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PROX1Q92786 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PROX1Q92786 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PROX1Q92786 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PROX1Q92786 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PROX1Q92786 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PROX1Q92786 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PROX1Q92786 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PROX1Q92786 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PROX1Q92786 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PROX1Q92786 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PROX1Q92786 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PROX1Q92786 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PROX1Q92786 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PROX1Q92786 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PROX1Q92786 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PROX1Q92786 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms