Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATRIPQ8WXE1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATRIPQ8WXE1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATRIPQ8WXE1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATRIPQ8WXE1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATRIPQ8WXE1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATRIPQ8WXE1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATRIPQ8WXE1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATRIPQ8WXE1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATRIPQ8WXE1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATRIPQ8WXE1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATRIPQ8WXE1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATRIPQ8WXE1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATRIPQ8WXE1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ATRIPQ8WXE1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATRIPQ8WXE1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATRIPQ8WXE1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATRIPQ8WXE1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATRIPQ8WXE1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATRIPQ8WXE1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATRIPQ8WXE1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATRIPQ8WXE1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATRIPQ8WXE1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATRIPQ8WXE1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATRIPQ8WXE1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATRIPQ8WXE1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATRIPQ8WXE1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATRIPQ8WXE1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATRIPQ8WXE1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATRIPQ8WXE1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATRIPQ8WXE1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATRIPQ8WXE1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATRIPQ8WXE1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATRIPQ8WXE1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATRIPQ8WXE1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATRIPQ8WXE1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATRIPQ8WXE1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATRIPQ8WXE1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATRIPQ8WXE1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATRIPQ8WXE1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATRIPQ8WXE1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATRIPQ8WXE1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATRIPQ8WXE1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATRIPQ8WXE1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATRIPQ8WXE1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATRIPQ8WXE1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATRIPQ8WXE1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATRIPQ8WXE1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATRIPQ8WXE1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATRIPQ8WXE1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATRIPQ8WXE1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATRIPQ8WXE1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATRIPQ8WXE1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATRIPQ8WXE1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATRIPQ8WXE1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATRIPQ8WXE1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATRIPQ8WXE1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATRIPQ8WXE1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATRIPQ8WXE1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATRIPQ8WXE1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATRIPQ8WXE1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATRIPQ8WXE1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATRIPQ8WXE1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATRIPQ8WXE1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATRIPQ8WXE1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATRIPQ8WXE1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATRIPQ8WXE1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATRIPQ8WXE1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATRIPQ8WXE1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATRIPQ8WXE1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATRIPQ8WXE1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATRIPQ8WXE1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATRIPQ8WXE1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATRIPQ8WXE1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATRIPQ8WXE1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATRIPQ8WXE1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATRIPQ8WXE1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATRIPQ8WXE1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATRIPQ8WXE1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATRIPQ8WXE1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATRIPQ8WXE1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATRIPQ8WXE1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ATRIPQ8WXE1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATRIPQ8WXE1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATRIPQ8WXE1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATRIPQ8WXE1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATRIPQ8WXE1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATRIPQ8WXE1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATRIPQ8WXE1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATRIPQ8WXE1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATRIPQ8WXE1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATRIPQ8WXE1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATRIPQ8WXE1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATRIPQ8WXE1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATRIPQ8WXE1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATRIPQ8WXE1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATRIPQ8WXE1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ATRIPQ8WXE1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATRIPQ8WXE1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATRIPQ8WXE1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.5 ms