Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
LMO7Q8WWI1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
LMO7Q8WWI1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
LMO7Q8WWI1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
LMO7Q8WWI1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
LMO7Q8WWI1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
LMO7Q8WWI1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
LMO7Q8WWI1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
LMO7Q8WWI1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
LMO7Q8WWI1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
LMO7Q8WWI1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
LMO7Q8WWI1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LMO7Q8WWI1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
LMO7Q8WWI1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
LMO7Q8WWI1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
LMO7Q8WWI1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
LMO7Q8WWI1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
LMO7Q8WWI1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
LMO7Q8WWI1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
LMO7Q8WWI1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
LMO7Q8WWI1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
LMO7Q8WWI1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
LMO7Q8WWI1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.17
LMO7Q8WWI1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
LMO7Q8WWI1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
LMO7Q8WWI1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
LMO7Q8WWI1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
LMO7Q8WWI1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
LMO7Q8WWI1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
LMO7Q8WWI1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
LMO7Q8WWI1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
LMO7Q8WWI1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
LMO7Q8WWI1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
LMO7Q8WWI1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
LMO7Q8WWI1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
LMO7Q8WWI1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
LMO7Q8WWI1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
LMO7Q8WWI1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
LMO7Q8WWI1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
LMO7Q8WWI1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
LMO7Q8WWI1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
LMO7Q8WWI1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
LMO7Q8WWI1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
LMO7Q8WWI1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
LMO7Q8WWI1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
LMO7Q8WWI1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
LMO7Q8WWI1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
LMO7Q8WWI1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
LMO7Q8WWI1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LMO7Q8WWI1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
LMO7Q8WWI1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
LMO7Q8WWI1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
LMO7Q8WWI1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
LMO7Q8WWI1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
LMO7Q8WWI1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
LMO7Q8WWI1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
LMO7Q8WWI1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LMO7Q8WWI1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
LMO7Q8WWI1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
LMO7Q8WWI1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
LMO7Q8WWI1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
LMO7Q8WWI1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
LMO7Q8WWI1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
LMO7Q8WWI1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
LMO7Q8WWI1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
LMO7Q8WWI1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
LMO7Q8WWI1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
LMO7Q8WWI1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
LMO7Q8WWI1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
LMO7Q8WWI1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
LMO7Q8WWI1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
LMO7Q8WWI1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
LMO7Q8WWI1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
LMO7Q8WWI1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
LMO7Q8WWI1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
LMO7Q8WWI1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
LMO7Q8WWI1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
LMO7Q8WWI1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
LMO7Q8WWI1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LMO7Q8WWI1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LMO7Q8WWI1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
LMO7Q8WWI1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
LMO7Q8WWI1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
LMO7Q8WWI1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
LMO7Q8WWI1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
LMO7Q8WWI1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
LMO7Q8WWI1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
LMO7Q8WWI1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
LMO7Q8WWI1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
LMO7Q8WWI1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
LMO7Q8WWI1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
LMO7Q8WWI1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LMO7Q8WWI1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LMO7Q8WWI1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
LMO7Q8WWI1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
LMO7Q8WWI1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
LMO7Q8WWI1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
LMO7Q8WWI1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
LMO7Q8WWI1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
LMO7Q8WWI1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms