Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB73

NDNF, Protein NDNF, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNFQ8TB73 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDNFQ8TB73 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDNFQ8TB73 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDNFQ8TB73 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDNFQ8TB73 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDNFQ8TB73 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDNFQ8TB73 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDNFQ8TB73 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDNFQ8TB73 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDNFQ8TB73 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDNFQ8TB73 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDNFQ8TB73 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDNFQ8TB73 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDNFQ8TB73 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDNFQ8TB73 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NDNFQ8TB73 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDNFQ8TB73 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDNFQ8TB73 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDNFQ8TB73 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDNFQ8TB73 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NDNFQ8TB73 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDNFQ8TB73 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDNFQ8TB73 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDNFQ8TB73 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NDNFQ8TB73 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NDNFQ8TB73 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDNFQ8TB73 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDNFQ8TB73 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDNFQ8TB73 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDNFQ8TB73 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDNFQ8TB73 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDNFQ8TB73 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDNFQ8TB73 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDNFQ8TB73 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDNFQ8TB73 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDNFQ8TB73 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDNFQ8TB73 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDNFQ8TB73 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NDNFQ8TB73 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDNFQ8TB73 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NDNFQ8TB73 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDNFQ8TB73 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDNFQ8TB73 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDNFQ8TB73 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDNFQ8TB73 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDNFQ8TB73 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDNFQ8TB73 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDNFQ8TB73 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDNFQ8TB73 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDNFQ8TB73 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDNFQ8TB73 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDNFQ8TB73 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDNFQ8TB73 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDNFQ8TB73 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDNFQ8TB73 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDNFQ8TB73 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDNFQ8TB73 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NDNFQ8TB73 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDNFQ8TB73 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDNFQ8TB73 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDNFQ8TB73 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDNFQ8TB73 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDNFQ8TB73 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDNFQ8TB73 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NDNFQ8TB73 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDNFQ8TB73 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDNFQ8TB73 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDNFQ8TB73 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDNFQ8TB73 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms