Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMO3Q8TAP4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMO3Q8TAP4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMO3Q8TAP4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMO3Q8TAP4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMO3Q8TAP4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LMO3Q8TAP4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMO3Q8TAP4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMO3Q8TAP4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMO3Q8TAP4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LMO3Q8TAP4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMO3Q8TAP4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMO3Q8TAP4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
LMO3Q8TAP4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LMO3Q8TAP4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMO3Q8TAP4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LMO3Q8TAP4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMO3Q8TAP4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMO3Q8TAP4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMO3Q8TAP4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMO3Q8TAP4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMO3Q8TAP4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMO3Q8TAP4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMO3Q8TAP4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMO3Q8TAP4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMO3Q8TAP4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMO3Q8TAP4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMO3Q8TAP4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMO3Q8TAP4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LMO3Q8TAP4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMO3Q8TAP4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMO3Q8TAP4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMO3Q8TAP4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMO3Q8TAP4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMO3Q8TAP4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMO3Q8TAP4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LMO3Q8TAP4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMO3Q8TAP4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMO3Q8TAP4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LMO3Q8TAP4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMO3Q8TAP4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMO3Q8TAP4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMO3Q8TAP4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMO3Q8TAP4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LMO3Q8TAP4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMO3Q8TAP4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMO3Q8TAP4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
LMO3Q8TAP4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LMO3Q8TAP4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LMO3Q8TAP4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.51■■■□□ 2
LMO3Q8TAP4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMO3Q8TAP4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMO3Q8TAP4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LMO3Q8TAP4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMO3Q8TAP4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMO3Q8TAP4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMO3Q8TAP4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMO3Q8TAP4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMO3Q8TAP4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMO3Q8TAP4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMO3Q8TAP4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMO3Q8TAP4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMO3Q8TAP4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMO3Q8TAP4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMO3Q8TAP4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMO3Q8TAP4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMO3Q8TAP4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMO3Q8TAP4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMO3Q8TAP4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMO3Q8TAP4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms