Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP61Q8NHU2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP61Q8NHU2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP61Q8NHU2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP61Q8NHU2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP61Q8NHU2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP61Q8NHU2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP61Q8NHU2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP61Q8NHU2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP61Q8NHU2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP61Q8NHU2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CFAP61Q8NHU2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CFAP61Q8NHU2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CFAP61Q8NHU2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CFAP61Q8NHU2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP61Q8NHU2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP61Q8NHU2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP61Q8NHU2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP61Q8NHU2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP61Q8NHU2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP61Q8NHU2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP61Q8NHU2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP61Q8NHU2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP61Q8NHU2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP61Q8NHU2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP61Q8NHU2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP61Q8NHU2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP61Q8NHU2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP61Q8NHU2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP61Q8NHU2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP61Q8NHU2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP61Q8NHU2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP61Q8NHU2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CFAP61Q8NHU2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP61Q8NHU2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP61Q8NHU2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP61Q8NHU2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP61Q8NHU2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP61Q8NHU2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP61Q8NHU2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP61Q8NHU2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP61Q8NHU2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP61Q8NHU2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP61Q8NHU2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP61Q8NHU2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP61Q8NHU2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP61Q8NHU2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP61Q8NHU2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP61Q8NHU2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP61Q8NHU2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP61Q8NHU2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP61Q8NHU2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP61Q8NHU2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP61Q8NHU2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP61Q8NHU2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP61Q8NHU2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP61Q8NHU2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP61Q8NHU2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP61Q8NHU2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP61Q8NHU2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP61Q8NHU2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP61Q8NHU2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP61Q8NHU2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP61Q8NHU2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP61Q8NHU2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP61Q8NHU2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP61Q8NHU2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP61Q8NHU2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP61Q8NHU2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP61Q8NHU2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP61Q8NHU2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP61Q8NHU2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP61Q8NHU2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP61Q8NHU2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP61Q8NHU2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP61Q8NHU2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP61Q8NHU2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP61Q8NHU2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP61Q8NHU2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CFAP61Q8NHU2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CFAP61Q8NHU2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CFAP61Q8NHU2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP61Q8NHU2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP61Q8NHU2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP61Q8NHU2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP61Q8NHU2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP61Q8NHU2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP61Q8NHU2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP61Q8NHU2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP61Q8NHU2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP61Q8NHU2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP61Q8NHU2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP61Q8NHU2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP61Q8NHU2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP61Q8NHU2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP61Q8NHU2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP61Q8NHU2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP61Q8NHU2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP61Q8NHU2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP61Q8NHU2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
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