Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEG7

DENND6B, Protein DENND6B, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND6BQ8NEG7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DENND6BQ8NEG7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND6BQ8NEG7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND6BQ8NEG7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND6BQ8NEG7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DENND6BQ8NEG7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DENND6BQ8NEG7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND6BQ8NEG7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND6BQ8NEG7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND6BQ8NEG7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DENND6BQ8NEG7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DENND6BQ8NEG7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DENND6BQ8NEG7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND6BQ8NEG7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND6BQ8NEG7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND6BQ8NEG7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND6BQ8NEG7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND6BQ8NEG7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND6BQ8NEG7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND6BQ8NEG7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND6BQ8NEG7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DENND6BQ8NEG7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DENND6BQ8NEG7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DENND6BQ8NEG7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DENND6BQ8NEG7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DENND6BQ8NEG7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DENND6BQ8NEG7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DENND6BQ8NEG7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DENND6BQ8NEG7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND6BQ8NEG7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND6BQ8NEG7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND6BQ8NEG7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND6BQ8NEG7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND6BQ8NEG7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DENND6BQ8NEG7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DENND6BQ8NEG7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DENND6BQ8NEG7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DENND6BQ8NEG7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DENND6BQ8NEG7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DENND6BQ8NEG7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DENND6BQ8NEG7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND6BQ8NEG7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND6BQ8NEG7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND6BQ8NEG7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND6BQ8NEG7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND6BQ8NEG7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DENND6BQ8NEG7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DENND6BQ8NEG7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DENND6BQ8NEG7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DENND6BQ8NEG7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DENND6BQ8NEG7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DENND6BQ8NEG7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DENND6BQ8NEG7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND6BQ8NEG7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND6BQ8NEG7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND6BQ8NEG7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND6BQ8NEG7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND6BQ8NEG7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND6BQ8NEG7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND6BQ8NEG7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND6BQ8NEG7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND6BQ8NEG7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND6BQ8NEG7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND6BQ8NEG7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND6BQ8NEG7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND6BQ8NEG7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND6BQ8NEG7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms