Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST4Q8NCG5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST4Q8NCG5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST4Q8NCG5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST4Q8NCG5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHST4Q8NCG5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHST4Q8NCG5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHST4Q8NCG5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHST4Q8NCG5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHST4Q8NCG5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHST4Q8NCG5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHST4Q8NCG5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHST4Q8NCG5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHST4Q8NCG5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHST4Q8NCG5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHST4Q8NCG5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHST4Q8NCG5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHST4Q8NCG5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHST4Q8NCG5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHST4Q8NCG5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHST4Q8NCG5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHST4Q8NCG5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHST4Q8NCG5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHST4Q8NCG5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHST4Q8NCG5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHST4Q8NCG5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHST4Q8NCG5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHST4Q8NCG5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHST4Q8NCG5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHST4Q8NCG5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHST4Q8NCG5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHST4Q8NCG5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHST4Q8NCG5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHST4Q8NCG5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHST4Q8NCG5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHST4Q8NCG5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHST4Q8NCG5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHST4Q8NCG5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHST4Q8NCG5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHST4Q8NCG5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHST4Q8NCG5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHST4Q8NCG5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHST4Q8NCG5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHST4Q8NCG5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHST4Q8NCG5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHST4Q8NCG5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHST4Q8NCG5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHST4Q8NCG5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHST4Q8NCG5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST4Q8NCG5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms