Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD12Q8N8I0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMD12Q8N8I0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMD12Q8N8I0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SAMD12Q8N8I0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SAMD12Q8N8I0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD12Q8N8I0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD12Q8N8I0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD12Q8N8I0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SAMD12Q8N8I0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD12Q8N8I0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD12Q8N8I0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD12Q8N8I0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD12Q8N8I0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SAMD12Q8N8I0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD12Q8N8I0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD12Q8N8I0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SAMD12Q8N8I0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD12Q8N8I0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SAMD12Q8N8I0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD12Q8N8I0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD12Q8N8I0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SAMD12Q8N8I0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SAMD12Q8N8I0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD12Q8N8I0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD12Q8N8I0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD12Q8N8I0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD12Q8N8I0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD12Q8N8I0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD12Q8N8I0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD12Q8N8I0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SAMD12Q8N8I0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD12Q8N8I0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD12Q8N8I0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD12Q8N8I0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD12Q8N8I0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SAMD12Q8N8I0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD12Q8N8I0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD12Q8N8I0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SAMD12Q8N8I0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD12Q8N8I0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SAMD12Q8N8I0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD12Q8N8I0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD12Q8N8I0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD12Q8N8I0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD12Q8N8I0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD12Q8N8I0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD12Q8N8I0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAMD12Q8N8I0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD12Q8N8I0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD12Q8N8I0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAMD12Q8N8I0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD12Q8N8I0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD12Q8N8I0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAMD12Q8N8I0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD12Q8N8I0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD12Q8N8I0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD12Q8N8I0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAMD12Q8N8I0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD12Q8N8I0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD12Q8N8I0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD12Q8N8I0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAMD12Q8N8I0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD12Q8N8I0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD12Q8N8I0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD12Q8N8I0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD12Q8N8I0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD12Q8N8I0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD12Q8N8I0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD12Q8N8I0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAMD12Q8N8I0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAMD12Q8N8I0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAMD12Q8N8I0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD12Q8N8I0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD12Q8N8I0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD12Q8N8I0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD12Q8N8I0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD12Q8N8I0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD12Q8N8I0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD12Q8N8I0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD12Q8N8I0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD12Q8N8I0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD12Q8N8I0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD12Q8N8I0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD12Q8N8I0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD12Q8N8I0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD12Q8N8I0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD12Q8N8I0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD12Q8N8I0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD12Q8N8I0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD12Q8N8I0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD12Q8N8I0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD12Q8N8I0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD12Q8N8I0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD12Q8N8I0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD12Q8N8I0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD12Q8N8I0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD12Q8N8I0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD12Q8N8I0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAMD12Q8N8I0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms