Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
VPS8Q8N3P4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
VPS8Q8N3P4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC40.77■■■■■ 4.12
VPS8Q8N3P4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
VPS8Q8N3P4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
VPS8Q8N3P4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
VPS8Q8N3P4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC40.75■■■■■ 4.11
VPS8Q8N3P4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40.75■■■■■ 4.11
VPS8Q8N3P4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
VPS8Q8N3P4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
VPS8Q8N3P4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
VPS8Q8N3P4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
VPS8Q8N3P4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
VPS8Q8N3P4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
VPS8Q8N3P4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
VPS8Q8N3P4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
VPS8Q8N3P4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
VPS8Q8N3P4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
VPS8Q8N3P4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
VPS8Q8N3P4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
VPS8Q8N3P4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
VPS8Q8N3P4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
VPS8Q8N3P4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
VPS8Q8N3P4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
VPS8Q8N3P4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
VPS8Q8N3P4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
VPS8Q8N3P4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
VPS8Q8N3P4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
VPS8Q8N3P4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
VPS8Q8N3P4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC40.65■■■■■ 4.1
VPS8Q8N3P4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
VPS8Q8N3P4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.1
VPS8Q8N3P4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
VPS8Q8N3P4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
VPS8Q8N3P4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
VPS8Q8N3P4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
VPS8Q8N3P4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
VPS8Q8N3P4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
VPS8Q8N3P4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
VPS8Q8N3P4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
VPS8Q8N3P4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
VPS8Q8N3P4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
VPS8Q8N3P4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
VPS8Q8N3P4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
VPS8Q8N3P4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
VPS8Q8N3P4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
VPS8Q8N3P4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
VPS8Q8N3P4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
VPS8Q8N3P4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
VPS8Q8N3P4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
VPS8Q8N3P4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
VPS8Q8N3P4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
VPS8Q8N3P4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
VPS8Q8N3P4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
VPS8Q8N3P4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
VPS8Q8N3P4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
VPS8Q8N3P4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
VPS8Q8N3P4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
VPS8Q8N3P4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
VPS8Q8N3P4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
VPS8Q8N3P4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
VPS8Q8N3P4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
VPS8Q8N3P4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
VPS8Q8N3P4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
VPS8Q8N3P4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
VPS8Q8N3P4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
VPS8Q8N3P4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
VPS8Q8N3P4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
VPS8Q8N3P4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
VPS8Q8N3P4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
VPS8Q8N3P4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
VPS8Q8N3P4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
VPS8Q8N3P4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
VPS8Q8N3P4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC40.44■■■■■ 4.06
VPS8Q8N3P4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
VPS8Q8N3P4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
VPS8Q8N3P4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
VPS8Q8N3P4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
VPS8Q8N3P4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
VPS8Q8N3P4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
VPS8Q8N3P4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
VPS8Q8N3P4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
VPS8Q8N3P4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
VPS8Q8N3P4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
VPS8Q8N3P4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
VPS8Q8N3P4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
VPS8Q8N3P4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
VPS8Q8N3P4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
VPS8Q8N3P4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
VPS8Q8N3P4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
VPS8Q8N3P4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
VPS8Q8N3P4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
VPS8Q8N3P4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
VPS8Q8N3P4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
VPS8Q8N3P4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
VPS8Q8N3P4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
VPS8Q8N3P4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
VPS8Q8N3P4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
VPS8Q8N3P4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC40.32■■■■■ 4.05
VPS8Q8N3P4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms