Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C17orf53Q8N3J3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C17orf53Q8N3J3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C17orf53Q8N3J3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C17orf53Q8N3J3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C17orf53Q8N3J3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C17orf53Q8N3J3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C17orf53Q8N3J3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C17orf53Q8N3J3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C17orf53Q8N3J3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C17orf53Q8N3J3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C17orf53Q8N3J3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C17orf53Q8N3J3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C17orf53Q8N3J3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C17orf53Q8N3J3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C17orf53Q8N3J3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C17orf53Q8N3J3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C17orf53Q8N3J3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
C17orf53Q8N3J3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
C17orf53Q8N3J3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C17orf53Q8N3J3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C17orf53Q8N3J3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C17orf53Q8N3J3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C17orf53Q8N3J3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C17orf53Q8N3J3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
C17orf53Q8N3J3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C17orf53Q8N3J3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C17orf53Q8N3J3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C17orf53Q8N3J3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C17orf53Q8N3J3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C17orf53Q8N3J3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
C17orf53Q8N3J3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C17orf53Q8N3J3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C17orf53Q8N3J3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C17orf53Q8N3J3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C17orf53Q8N3J3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C17orf53Q8N3J3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C17orf53Q8N3J3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C17orf53Q8N3J3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
C17orf53Q8N3J3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C17orf53Q8N3J3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C17orf53Q8N3J3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C17orf53Q8N3J3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C17orf53Q8N3J3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C17orf53Q8N3J3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
C17orf53Q8N3J3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
C17orf53Q8N3J3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C17orf53Q8N3J3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C17orf53Q8N3J3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C17orf53Q8N3J3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C17orf53Q8N3J3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C17orf53Q8N3J3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C17orf53Q8N3J3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C17orf53Q8N3J3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C17orf53Q8N3J3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C17orf53Q8N3J3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C17orf53Q8N3J3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C17orf53Q8N3J3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C17orf53Q8N3J3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C17orf53Q8N3J3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C17orf53Q8N3J3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C17orf53Q8N3J3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C17orf53Q8N3J3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C17orf53Q8N3J3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C17orf53Q8N3J3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
C17orf53Q8N3J3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C17orf53Q8N3J3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C17orf53Q8N3J3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C17orf53Q8N3J3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C17orf53Q8N3J3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C17orf53Q8N3J3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C17orf53Q8N3J3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C17orf53Q8N3J3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C17orf53Q8N3J3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
C17orf53Q8N3J3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
C17orf53Q8N3J3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C17orf53Q8N3J3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C17orf53Q8N3J3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C17orf53Q8N3J3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C17orf53Q8N3J3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C17orf53Q8N3J3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C17orf53Q8N3J3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C17orf53Q8N3J3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C17orf53Q8N3J3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C17orf53Q8N3J3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C17orf53Q8N3J3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C17orf53Q8N3J3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C17orf53Q8N3J3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
C17orf53Q8N3J3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C17orf53Q8N3J3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C17orf53Q8N3J3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C17orf53Q8N3J3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C17orf53Q8N3J3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
C17orf53Q8N3J3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C17orf53Q8N3J3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C17orf53Q8N3J3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C17orf53Q8N3J3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C17orf53Q8N3J3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C17orf53Q8N3J3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C17orf53Q8N3J3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms