Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPAS3Q8IXF0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPAS3Q8IXF0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPAS3Q8IXF0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPAS3Q8IXF0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPAS3Q8IXF0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NPAS3Q8IXF0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPAS3Q8IXF0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPAS3Q8IXF0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPAS3Q8IXF0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPAS3Q8IXF0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPAS3Q8IXF0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPAS3Q8IXF0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPAS3Q8IXF0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPAS3Q8IXF0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPAS3Q8IXF0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPAS3Q8IXF0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPAS3Q8IXF0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPAS3Q8IXF0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPAS3Q8IXF0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPAS3Q8IXF0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPAS3Q8IXF0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPAS3Q8IXF0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPAS3Q8IXF0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPAS3Q8IXF0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPAS3Q8IXF0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPAS3Q8IXF0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPAS3Q8IXF0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPAS3Q8IXF0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPAS3Q8IXF0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPAS3Q8IXF0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPAS3Q8IXF0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPAS3Q8IXF0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPAS3Q8IXF0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPAS3Q8IXF0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPAS3Q8IXF0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPAS3Q8IXF0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NPAS3Q8IXF0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPAS3Q8IXF0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NPAS3Q8IXF0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPAS3Q8IXF0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPAS3Q8IXF0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPAS3Q8IXF0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPAS3Q8IXF0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NPAS3Q8IXF0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPAS3Q8IXF0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPAS3Q8IXF0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPAS3Q8IXF0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPAS3Q8IXF0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NPAS3Q8IXF0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NPAS3Q8IXF0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NPAS3Q8IXF0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NPAS3Q8IXF0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPAS3Q8IXF0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPAS3Q8IXF0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPAS3Q8IXF0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPAS3Q8IXF0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPAS3Q8IXF0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPAS3Q8IXF0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPAS3Q8IXF0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPAS3Q8IXF0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NPAS3Q8IXF0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPAS3Q8IXF0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPAS3Q8IXF0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPAS3Q8IXF0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPAS3Q8IXF0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPAS3Q8IXF0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPAS3Q8IXF0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPAS3Q8IXF0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NPAS3Q8IXF0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NPAS3Q8IXF0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NPAS3Q8IXF0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPAS3Q8IXF0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPAS3Q8IXF0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPAS3Q8IXF0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPAS3Q8IXF0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPAS3Q8IXF0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPAS3Q8IXF0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPAS3Q8IXF0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPAS3Q8IXF0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPAS3Q8IXF0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPAS3Q8IXF0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPAS3Q8IXF0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPAS3Q8IXF0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPAS3Q8IXF0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPAS3Q8IXF0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPAS3Q8IXF0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPAS3Q8IXF0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NPAS3Q8IXF0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPAS3Q8IXF0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
NPAS3Q8IXF0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NPAS3Q8IXF0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NPAS3Q8IXF0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPAS3Q8IXF0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPAS3Q8IXF0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPAS3Q8IXF0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPAS3Q8IXF0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPAS3Q8IXF0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPAS3Q8IXF0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPAS3Q8IXF0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms