Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCN4BQ8IWT1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCN4BQ8IWT1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN4BQ8IWT1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCN4BQ8IWT1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN4BQ8IWT1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN4BQ8IWT1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN4BQ8IWT1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN4BQ8IWT1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN4BQ8IWT1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN4BQ8IWT1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN4BQ8IWT1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN4BQ8IWT1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN4BQ8IWT1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN4BQ8IWT1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN4BQ8IWT1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN4BQ8IWT1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN4BQ8IWT1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN4BQ8IWT1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN4BQ8IWT1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN4BQ8IWT1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN4BQ8IWT1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN4BQ8IWT1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN4BQ8IWT1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN4BQ8IWT1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN4BQ8IWT1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN4BQ8IWT1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN4BQ8IWT1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN4BQ8IWT1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN4BQ8IWT1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN4BQ8IWT1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN4BQ8IWT1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN4BQ8IWT1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN4BQ8IWT1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCN4BQ8IWT1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SCN4BQ8IWT1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SCN4BQ8IWT1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN4BQ8IWT1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN4BQ8IWT1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN4BQ8IWT1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN4BQ8IWT1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN4BQ8IWT1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN4BQ8IWT1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN4BQ8IWT1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN4BQ8IWT1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN4BQ8IWT1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN4BQ8IWT1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN4BQ8IWT1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN4BQ8IWT1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN4BQ8IWT1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN4BQ8IWT1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN4BQ8IWT1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN4BQ8IWT1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN4BQ8IWT1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN4BQ8IWT1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN4BQ8IWT1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN4BQ8IWT1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN4BQ8IWT1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN4BQ8IWT1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN4BQ8IWT1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN4BQ8IWT1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN4BQ8IWT1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN4BQ8IWT1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN4BQ8IWT1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN4BQ8IWT1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN4BQ8IWT1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN4BQ8IWT1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN4BQ8IWT1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN4BQ8IWT1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN4BQ8IWT1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms