Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWA5

SLC44A2, Choline transporter-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A2Q8IWA5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC44A2Q8IWA5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC44A2Q8IWA5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC44A2Q8IWA5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC44A2Q8IWA5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC44A2Q8IWA5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC44A2Q8IWA5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC44A2Q8IWA5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC44A2Q8IWA5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC44A2Q8IWA5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC44A2Q8IWA5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC44A2Q8IWA5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC44A2Q8IWA5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC44A2Q8IWA5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC44A2Q8IWA5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC44A2Q8IWA5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC44A2Q8IWA5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC44A2Q8IWA5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC44A2Q8IWA5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC44A2Q8IWA5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC44A2Q8IWA5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC44A2Q8IWA5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A2Q8IWA5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A2Q8IWA5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A2Q8IWA5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A2Q8IWA5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC44A2Q8IWA5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC44A2Q8IWA5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC44A2Q8IWA5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC44A2Q8IWA5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A2Q8IWA5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A2Q8IWA5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A2Q8IWA5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A2Q8IWA5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A2Q8IWA5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A2Q8IWA5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A2Q8IWA5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A2Q8IWA5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A2Q8IWA5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC44A2Q8IWA5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC44A2Q8IWA5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A2Q8IWA5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A2Q8IWA5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A2Q8IWA5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A2Q8IWA5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A2Q8IWA5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A2Q8IWA5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A2Q8IWA5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A2Q8IWA5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A2Q8IWA5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A2Q8IWA5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A2Q8IWA5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A2Q8IWA5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A2Q8IWA5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A2Q8IWA5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A2Q8IWA5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC44A2Q8IWA5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC44A2Q8IWA5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC44A2Q8IWA5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC44A2Q8IWA5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC44A2Q8IWA5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC44A2Q8IWA5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC44A2Q8IWA5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC44A2Q8IWA5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC44A2Q8IWA5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC44A2Q8IWA5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC44A2Q8IWA5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC44A2Q8IWA5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC44A2Q8IWA5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC44A2Q8IWA5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC44A2Q8IWA5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC44A2Q8IWA5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC44A2Q8IWA5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC44A2Q8IWA5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC44A2Q8IWA5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC44A2Q8IWA5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC44A2Q8IWA5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC44A2Q8IWA5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC44A2Q8IWA5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC44A2Q8IWA5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC44A2Q8IWA5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC44A2Q8IWA5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC44A2Q8IWA5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC44A2Q8IWA5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC44A2Q8IWA5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC44A2Q8IWA5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC44A2Q8IWA5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC44A2Q8IWA5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC44A2Q8IWA5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC44A2Q8IWA5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC44A2Q8IWA5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC44A2Q8IWA5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC44A2Q8IWA5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC44A2Q8IWA5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC44A2Q8IWA5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC44A2Q8IWA5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC44A2Q8IWA5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC44A2Q8IWA5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC44A2Q8IWA5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC44A2Q8IWA5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms