Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX29P2Q8IUI4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX29P2Q8IUI4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX29P2Q8IUI4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX29P2Q8IUI4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX29P2Q8IUI4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX29P2Q8IUI4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX29P2Q8IUI4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX29P2Q8IUI4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX29P2Q8IUI4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX29P2Q8IUI4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX29P2Q8IUI4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX29P2Q8IUI4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX29P2Q8IUI4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX29P2Q8IUI4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX29P2Q8IUI4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX29P2Q8IUI4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX29P2Q8IUI4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX29P2Q8IUI4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX29P2Q8IUI4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX29P2Q8IUI4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX29P2Q8IUI4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX29P2Q8IUI4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX29P2Q8IUI4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX29P2Q8IUI4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX29P2Q8IUI4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX29P2Q8IUI4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX29P2Q8IUI4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX29P2Q8IUI4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX29P2Q8IUI4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX29P2Q8IUI4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX29P2Q8IUI4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX29P2Q8IUI4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX29P2Q8IUI4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX29P2Q8IUI4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX29P2Q8IUI4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX29P2Q8IUI4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX29P2Q8IUI4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX29P2Q8IUI4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX29P2Q8IUI4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX29P2Q8IUI4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX29P2Q8IUI4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX29P2Q8IUI4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX29P2Q8IUI4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX29P2Q8IUI4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX29P2Q8IUI4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX29P2Q8IUI4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX29P2Q8IUI4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX29P2Q8IUI4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX29P2Q8IUI4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX29P2Q8IUI4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX29P2Q8IUI4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX29P2Q8IUI4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX29P2Q8IUI4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX29P2Q8IUI4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX29P2Q8IUI4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX29P2Q8IUI4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX29P2Q8IUI4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX29P2Q8IUI4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX29P2Q8IUI4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX29P2Q8IUI4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX29P2Q8IUI4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX29P2Q8IUI4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX29P2Q8IUI4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX29P2Q8IUI4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX29P2Q8IUI4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX29P2Q8IUI4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX29P2Q8IUI4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX29P2Q8IUI4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX29P2Q8IUI4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX29P2Q8IUI4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX29P2Q8IUI4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX29P2Q8IUI4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX29P2Q8IUI4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX29P2Q8IUI4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX29P2Q8IUI4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX29P2Q8IUI4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX29P2Q8IUI4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX29P2Q8IUI4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX29P2Q8IUI4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX29P2Q8IUI4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX29P2Q8IUI4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX29P2Q8IUI4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX29P2Q8IUI4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX29P2Q8IUI4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX29P2Q8IUI4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX29P2Q8IUI4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX29P2Q8IUI4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX29P2Q8IUI4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX29P2Q8IUI4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX29P2Q8IUI4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX29P2Q8IUI4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX29P2Q8IUI4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX29P2Q8IUI4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX29P2Q8IUI4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms