Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNMB4Q86W47 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNMB4Q86W47 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNMB4Q86W47 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNMB4Q86W47 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNMB4Q86W47 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNMB4Q86W47 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNMB4Q86W47 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNMB4Q86W47 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNMB4Q86W47 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNMB4Q86W47 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNMB4Q86W47 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNMB4Q86W47 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNMB4Q86W47 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNMB4Q86W47 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNMB4Q86W47 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNMB4Q86W47 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNMB4Q86W47 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNMB4Q86W47 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNMB4Q86W47 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNMB4Q86W47 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNMB4Q86W47 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KCNMB4Q86W47 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KCNMB4Q86W47 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNMB4Q86W47 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNMB4Q86W47 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNMB4Q86W47 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNMB4Q86W47 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNMB4Q86W47 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNMB4Q86W47 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNMB4Q86W47 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNMB4Q86W47 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNMB4Q86W47 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNMB4Q86W47 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNMB4Q86W47 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNMB4Q86W47 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNMB4Q86W47 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNMB4Q86W47 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNMB4Q86W47 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNMB4Q86W47 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNMB4Q86W47 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNMB4Q86W47 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNMB4Q86W47 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNMB4Q86W47 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNMB4Q86W47 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNMB4Q86W47 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNMB4Q86W47 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNMB4Q86W47 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNMB4Q86W47 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNMB4Q86W47 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNMB4Q86W47 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNMB4Q86W47 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNMB4Q86W47 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNMB4Q86W47 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNMB4Q86W47 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNMB4Q86W47 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNMB4Q86W47 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNMB4Q86W47 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNMB4Q86W47 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNMB4Q86W47 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNMB4Q86W47 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNMB4Q86W47 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNMB4Q86W47 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNMB4Q86W47 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNMB4Q86W47 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNMB4Q86W47 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNMB4Q86W47 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNMB4Q86W47 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNMB4Q86W47 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNMB4Q86W47 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNMB4Q86W47 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNMB4Q86W47 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNMB4Q86W47 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNMB4Q86W47 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNMB4Q86W47 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNMB4Q86W47 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNMB4Q86W47 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNMB4Q86W47 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNMB4Q86W47 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNMB4Q86W47 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNMB4Q86W47 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNMB4Q86W47 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNMB4Q86W47 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNMB4Q86W47 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNMB4Q86W47 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNMB4Q86W47 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNMB4Q86W47 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNMB4Q86W47 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNMB4Q86W47 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNMB4Q86W47 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNMB4Q86W47 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNMB4Q86W47 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNMB4Q86W47 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNMB4Q86W47 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNMB4Q86W47 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNMB4Q86W47 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNMB4Q86W47 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNMB4Q86W47 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNMB4Q86W47 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNMB4Q86W47 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms