Protein–RNA interactions for Protein: Q86SJ6

DSG4, Desmoglein-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG4Q86SJ6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DSG4Q86SJ6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DSG4Q86SJ6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSG4Q86SJ6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSG4Q86SJ6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSG4Q86SJ6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSG4Q86SJ6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DSG4Q86SJ6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DSG4Q86SJ6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DSG4Q86SJ6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DSG4Q86SJ6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DSG4Q86SJ6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSG4Q86SJ6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DSG4Q86SJ6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DSG4Q86SJ6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DSG4Q86SJ6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DSG4Q86SJ6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DSG4Q86SJ6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DSG4Q86SJ6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DSG4Q86SJ6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSG4Q86SJ6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSG4Q86SJ6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSG4Q86SJ6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSG4Q86SJ6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSG4Q86SJ6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DSG4Q86SJ6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSG4Q86SJ6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSG4Q86SJ6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSG4Q86SJ6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DSG4Q86SJ6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DSG4Q86SJ6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DSG4Q86SJ6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DSG4Q86SJ6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DSG4Q86SJ6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DSG4Q86SJ6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DSG4Q86SJ6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DSG4Q86SJ6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DSG4Q86SJ6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DSG4Q86SJ6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DSG4Q86SJ6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DSG4Q86SJ6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DSG4Q86SJ6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DSG4Q86SJ6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DSG4Q86SJ6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DSG4Q86SJ6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DSG4Q86SJ6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DSG4Q86SJ6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DSG4Q86SJ6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSG4Q86SJ6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSG4Q86SJ6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSG4Q86SJ6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG4Q86SJ6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG4Q86SJ6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG4Q86SJ6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG4Q86SJ6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG4Q86SJ6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSG4Q86SJ6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSG4Q86SJ6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DSG4Q86SJ6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DSG4Q86SJ6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DSG4Q86SJ6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSG4Q86SJ6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSG4Q86SJ6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSG4Q86SJ6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSG4Q86SJ6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSG4Q86SJ6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSG4Q86SJ6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms