Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC80Q76M96 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC80Q76M96 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC80Q76M96 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC80Q76M96 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC80Q76M96 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC80Q76M96 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC80Q76M96 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC80Q76M96 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC80Q76M96 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC80Q76M96 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC80Q76M96 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC80Q76M96 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC80Q76M96 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC80Q76M96 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC80Q76M96 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC80Q76M96 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC80Q76M96 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC80Q76M96 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC80Q76M96 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC80Q76M96 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC80Q76M96 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC80Q76M96 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC80Q76M96 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC80Q76M96 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC80Q76M96 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC80Q76M96 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC80Q76M96 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC80Q76M96 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC80Q76M96 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC80Q76M96 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC80Q76M96 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC80Q76M96 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC80Q76M96 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC80Q76M96 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC80Q76M96 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC80Q76M96 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC80Q76M96 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC80Q76M96 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC80Q76M96 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC80Q76M96 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC80Q76M96 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC80Q76M96 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC80Q76M96 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC80Q76M96 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC80Q76M96 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC80Q76M96 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC80Q76M96 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC80Q76M96 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC80Q76M96 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC80Q76M96 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC80Q76M96 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC80Q76M96 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC80Q76M96 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC80Q76M96 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC80Q76M96 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC80Q76M96 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC80Q76M96 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC80Q76M96 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC80Q76M96 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC80Q76M96 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC80Q76M96 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC80Q76M96 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC80Q76M96 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC80Q76M96 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC80Q76M96 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC80Q76M96 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC80Q76M96 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC80Q76M96 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC80Q76M96 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC80Q76M96 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC80Q76M96 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC80Q76M96 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC80Q76M96 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC80Q76M96 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC80Q76M96 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC80Q76M96 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC80Q76M96 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC80Q76M96 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC80Q76M96 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC80Q76M96 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC80Q76M96 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC80Q76M96 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC80Q76M96 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC80Q76M96 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC80Q76M96 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC80Q76M96 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC80Q76M96 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC80Q76M96 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC80Q76M96 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC80Q76M96 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC80Q76M96 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC80Q76M96 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC80Q76M96 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC80Q76M96 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC80Q76M96 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC80Q76M96 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC80Q76M96 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC80Q76M96 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC80Q76M96 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms