Protein–RNA interactions for Protein: Q71UM5

RPS27L, 40S ribosomal protein S27-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27LQ71UM5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS27LQ71UM5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS27LQ71UM5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS27LQ71UM5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS27LQ71UM5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS27LQ71UM5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS27LQ71UM5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS27LQ71UM5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS27LQ71UM5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS27LQ71UM5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS27LQ71UM5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS27LQ71UM5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS27LQ71UM5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS27LQ71UM5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS27LQ71UM5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS27LQ71UM5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS27LQ71UM5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS27LQ71UM5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS27LQ71UM5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS27LQ71UM5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS27LQ71UM5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS27LQ71UM5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS27LQ71UM5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS27LQ71UM5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS27LQ71UM5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS27LQ71UM5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS27LQ71UM5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS27LQ71UM5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS27LQ71UM5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS27LQ71UM5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS27LQ71UM5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS27LQ71UM5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS27LQ71UM5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS27LQ71UM5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RPS27LQ71UM5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS27LQ71UM5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPS27LQ71UM5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS27LQ71UM5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS27LQ71UM5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS27LQ71UM5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS27LQ71UM5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS27LQ71UM5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS27LQ71UM5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS27LQ71UM5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS27LQ71UM5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS27LQ71UM5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS27LQ71UM5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS27LQ71UM5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS27LQ71UM5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS27LQ71UM5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS27LQ71UM5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS27LQ71UM5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS27LQ71UM5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS27LQ71UM5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS27LQ71UM5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RPS27LQ71UM5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS27LQ71UM5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS27LQ71UM5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS27LQ71UM5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS27LQ71UM5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS27LQ71UM5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS27LQ71UM5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS27LQ71UM5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS27LQ71UM5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS27LQ71UM5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS27LQ71UM5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS27LQ71UM5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS27LQ71UM5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS27LQ71UM5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS27LQ71UM5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS27LQ71UM5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS27LQ71UM5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS27LQ71UM5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS27LQ71UM5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS27LQ71UM5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS27LQ71UM5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS27LQ71UM5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS27LQ71UM5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS27LQ71UM5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS27LQ71UM5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS27LQ71UM5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPS27LQ71UM5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS27LQ71UM5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS27LQ71UM5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS27LQ71UM5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS27LQ71UM5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS27LQ71UM5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS27LQ71UM5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS27LQ71UM5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS27LQ71UM5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS27LQ71UM5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS27LQ71UM5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS27LQ71UM5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS27LQ71UM5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS27LQ71UM5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS27LQ71UM5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS27LQ71UM5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS27LQ71UM5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS27LQ71UM5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS27LQ71UM5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms