Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMUB2Q71RG4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMUB2Q71RG4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMUB2Q71RG4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms