Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHSY3Q70JA7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHSY3Q70JA7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHSY3Q70JA7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHSY3Q70JA7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHSY3Q70JA7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHSY3Q70JA7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHSY3Q70JA7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHSY3Q70JA7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHSY3Q70JA7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHSY3Q70JA7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHSY3Q70JA7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHSY3Q70JA7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHSY3Q70JA7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHSY3Q70JA7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHSY3Q70JA7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHSY3Q70JA7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHSY3Q70JA7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHSY3Q70JA7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHSY3Q70JA7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHSY3Q70JA7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHSY3Q70JA7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHSY3Q70JA7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHSY3Q70JA7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHSY3Q70JA7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHSY3Q70JA7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHSY3Q70JA7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHSY3Q70JA7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHSY3Q70JA7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHSY3Q70JA7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHSY3Q70JA7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHSY3Q70JA7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHSY3Q70JA7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CHSY3Q70JA7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHSY3Q70JA7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHSY3Q70JA7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHSY3Q70JA7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHSY3Q70JA7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHSY3Q70JA7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHSY3Q70JA7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHSY3Q70JA7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHSY3Q70JA7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHSY3Q70JA7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHSY3Q70JA7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHSY3Q70JA7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHSY3Q70JA7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHSY3Q70JA7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHSY3Q70JA7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHSY3Q70JA7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHSY3Q70JA7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHSY3Q70JA7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHSY3Q70JA7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms