Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMK1

CYHR1, Cysteine and histidine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYHR1Q6ZMK1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYHR1Q6ZMK1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYHR1Q6ZMK1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYHR1Q6ZMK1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYHR1Q6ZMK1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYHR1Q6ZMK1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CYHR1Q6ZMK1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYHR1Q6ZMK1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYHR1Q6ZMK1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYHR1Q6ZMK1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYHR1Q6ZMK1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CYHR1Q6ZMK1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYHR1Q6ZMK1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYHR1Q6ZMK1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYHR1Q6ZMK1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYHR1Q6ZMK1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYHR1Q6ZMK1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYHR1Q6ZMK1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYHR1Q6ZMK1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYHR1Q6ZMK1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYHR1Q6ZMK1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYHR1Q6ZMK1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYHR1Q6ZMK1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYHR1Q6ZMK1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYHR1Q6ZMK1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYHR1Q6ZMK1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYHR1Q6ZMK1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYHR1Q6ZMK1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CYHR1Q6ZMK1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYHR1Q6ZMK1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYHR1Q6ZMK1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYHR1Q6ZMK1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYHR1Q6ZMK1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYHR1Q6ZMK1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYHR1Q6ZMK1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYHR1Q6ZMK1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CYHR1Q6ZMK1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYHR1Q6ZMK1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYHR1Q6ZMK1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYHR1Q6ZMK1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYHR1Q6ZMK1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYHR1Q6ZMK1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYHR1Q6ZMK1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYHR1Q6ZMK1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYHR1Q6ZMK1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYHR1Q6ZMK1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYHR1Q6ZMK1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYHR1Q6ZMK1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYHR1Q6ZMK1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYHR1Q6ZMK1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYHR1Q6ZMK1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYHR1Q6ZMK1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYHR1Q6ZMK1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYHR1Q6ZMK1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYHR1Q6ZMK1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYHR1Q6ZMK1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYHR1Q6ZMK1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYHR1Q6ZMK1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYHR1Q6ZMK1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CYHR1Q6ZMK1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CYHR1Q6ZMK1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYHR1Q6ZMK1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYHR1Q6ZMK1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYHR1Q6ZMK1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CYHR1Q6ZMK1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYHR1Q6ZMK1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYHR1Q6ZMK1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYHR1Q6ZMK1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYHR1Q6ZMK1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms