Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC36A4Q6YBV0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC36A4Q6YBV0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC36A4Q6YBV0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC36A4Q6YBV0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC36A4Q6YBV0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC36A4Q6YBV0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC36A4Q6YBV0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC36A4Q6YBV0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC36A4Q6YBV0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC36A4Q6YBV0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC36A4Q6YBV0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC36A4Q6YBV0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC36A4Q6YBV0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC36A4Q6YBV0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC36A4Q6YBV0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC36A4Q6YBV0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC36A4Q6YBV0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC36A4Q6YBV0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC36A4Q6YBV0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC36A4Q6YBV0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC36A4Q6YBV0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC36A4Q6YBV0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC36A4Q6YBV0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC36A4Q6YBV0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC36A4Q6YBV0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC36A4Q6YBV0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC36A4Q6YBV0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC36A4Q6YBV0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC36A4Q6YBV0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC36A4Q6YBV0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC36A4Q6YBV0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC36A4Q6YBV0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC36A4Q6YBV0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC36A4Q6YBV0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC36A4Q6YBV0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC36A4Q6YBV0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC36A4Q6YBV0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC36A4Q6YBV0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC36A4Q6YBV0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC36A4Q6YBV0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC36A4Q6YBV0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC36A4Q6YBV0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC36A4Q6YBV0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC36A4Q6YBV0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC36A4Q6YBV0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC36A4Q6YBV0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC36A4Q6YBV0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC36A4Q6YBV0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC36A4Q6YBV0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC36A4Q6YBV0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC36A4Q6YBV0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC36A4Q6YBV0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC36A4Q6YBV0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC36A4Q6YBV0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC36A4Q6YBV0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC36A4Q6YBV0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC36A4Q6YBV0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC36A4Q6YBV0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC36A4Q6YBV0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC36A4Q6YBV0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC36A4Q6YBV0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC36A4Q6YBV0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC36A4Q6YBV0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC36A4Q6YBV0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC36A4Q6YBV0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC36A4Q6YBV0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC36A4Q6YBV0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC36A4Q6YBV0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC36A4Q6YBV0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC36A4Q6YBV0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC36A4Q6YBV0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC36A4Q6YBV0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC36A4Q6YBV0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC36A4Q6YBV0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC36A4Q6YBV0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC36A4Q6YBV0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC36A4Q6YBV0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC36A4Q6YBV0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC36A4Q6YBV0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC36A4Q6YBV0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC36A4Q6YBV0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC36A4Q6YBV0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC36A4Q6YBV0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC36A4Q6YBV0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC36A4Q6YBV0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC36A4Q6YBV0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC36A4Q6YBV0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC36A4Q6YBV0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC36A4Q6YBV0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC36A4Q6YBV0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC36A4Q6YBV0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC36A4Q6YBV0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC36A4Q6YBV0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC36A4Q6YBV0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC36A4Q6YBV0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC36A4Q6YBV0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC36A4Q6YBV0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC36A4Q6YBV0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC36A4Q6YBV0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms