Protein–RNA interactions for Protein: Q6P597

KLC3, Kinesin light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC3Q6P597 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLC3Q6P597 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLC3Q6P597 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLC3Q6P597 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLC3Q6P597 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLC3Q6P597 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLC3Q6P597 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLC3Q6P597 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLC3Q6P597 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLC3Q6P597 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLC3Q6P597 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLC3Q6P597 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLC3Q6P597 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLC3Q6P597 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLC3Q6P597 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLC3Q6P597 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLC3Q6P597 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLC3Q6P597 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KLC3Q6P597 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLC3Q6P597 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLC3Q6P597 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLC3Q6P597 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLC3Q6P597 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLC3Q6P597 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLC3Q6P597 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLC3Q6P597 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KLC3Q6P597 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLC3Q6P597 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLC3Q6P597 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLC3Q6P597 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLC3Q6P597 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLC3Q6P597 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLC3Q6P597 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLC3Q6P597 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLC3Q6P597 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLC3Q6P597 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLC3Q6P597 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLC3Q6P597 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLC3Q6P597 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KLC3Q6P597 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLC3Q6P597 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLC3Q6P597 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLC3Q6P597 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLC3Q6P597 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLC3Q6P597 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KLC3Q6P597 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLC3Q6P597 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLC3Q6P597 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLC3Q6P597 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLC3Q6P597 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KLC3Q6P597 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLC3Q6P597 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLC3Q6P597 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLC3Q6P597 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLC3Q6P597 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLC3Q6P597 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLC3Q6P597 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLC3Q6P597 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLC3Q6P597 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KLC3Q6P597 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLC3Q6P597 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLC3Q6P597 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLC3Q6P597 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLC3Q6P597 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLC3Q6P597 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KLC3Q6P597 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KLC3Q6P597 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLC3Q6P597 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLC3Q6P597 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLC3Q6P597 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLC3Q6P597 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLC3Q6P597 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KLC3Q6P597 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLC3Q6P597 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLC3Q6P597 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLC3Q6P597 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLC3Q6P597 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLC3Q6P597 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLC3Q6P597 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLC3Q6P597 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KLC3Q6P597 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLC3Q6P597 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KLC3Q6P597 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLC3Q6P597 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLC3Q6P597 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLC3Q6P597 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLC3Q6P597 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLC3Q6P597 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLC3Q6P597 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLC3Q6P597 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLC3Q6P597 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLC3Q6P597 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLC3Q6P597 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLC3Q6P597 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLC3Q6P597 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLC3Q6P597 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLC3Q6P597 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLC3Q6P597 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLC3Q6P597 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLC3Q6P597 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms