Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNNM4Q6P4Q7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNNM4Q6P4Q7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNNM4Q6P4Q7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNNM4Q6P4Q7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNNM4Q6P4Q7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNNM4Q6P4Q7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNNM4Q6P4Q7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNNM4Q6P4Q7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNNM4Q6P4Q7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNNM4Q6P4Q7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNNM4Q6P4Q7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNNM4Q6P4Q7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNNM4Q6P4Q7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNNM4Q6P4Q7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNNM4Q6P4Q7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNNM4Q6P4Q7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNNM4Q6P4Q7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNNM4Q6P4Q7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNNM4Q6P4Q7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNNM4Q6P4Q7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CNNM4Q6P4Q7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNNM4Q6P4Q7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNNM4Q6P4Q7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNNM4Q6P4Q7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNNM4Q6P4Q7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNNM4Q6P4Q7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNNM4Q6P4Q7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNNM4Q6P4Q7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNNM4Q6P4Q7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNNM4Q6P4Q7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNNM4Q6P4Q7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNNM4Q6P4Q7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CNNM4Q6P4Q7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNNM4Q6P4Q7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNNM4Q6P4Q7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNNM4Q6P4Q7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNNM4Q6P4Q7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNNM4Q6P4Q7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNNM4Q6P4Q7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNNM4Q6P4Q7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNNM4Q6P4Q7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNNM4Q6P4Q7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNNM4Q6P4Q7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNNM4Q6P4Q7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNNM4Q6P4Q7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNNM4Q6P4Q7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNNM4Q6P4Q7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNNM4Q6P4Q7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNNM4Q6P4Q7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNNM4Q6P4Q7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNNM4Q6P4Q7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNNM4Q6P4Q7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNNM4Q6P4Q7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNNM4Q6P4Q7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNNM4Q6P4Q7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNNM4Q6P4Q7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNNM4Q6P4Q7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNNM4Q6P4Q7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNNM4Q6P4Q7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNNM4Q6P4Q7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNNM4Q6P4Q7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNNM4Q6P4Q7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CNNM4Q6P4Q7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNNM4Q6P4Q7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNNM4Q6P4Q7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNNM4Q6P4Q7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNNM4Q6P4Q7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CNNM4Q6P4Q7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNNM4Q6P4Q7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CNNM4Q6P4Q7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CNNM4Q6P4Q7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CNNM4Q6P4Q7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNNM4Q6P4Q7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNNM4Q6P4Q7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CNNM4Q6P4Q7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNNM4Q6P4Q7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNNM4Q6P4Q7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNNM4Q6P4Q7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNNM4Q6P4Q7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNNM4Q6P4Q7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNNM4Q6P4Q7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNNM4Q6P4Q7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNNM4Q6P4Q7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNNM4Q6P4Q7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNNM4Q6P4Q7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNNM4Q6P4Q7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNNM4Q6P4Q7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNNM4Q6P4Q7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNNM4Q6P4Q7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNNM4Q6P4Q7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNNM4Q6P4Q7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNNM4Q6P4Q7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNNM4Q6P4Q7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CNNM4Q6P4Q7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNNM4Q6P4Q7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNNM4Q6P4Q7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNNM4Q6P4Q7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNNM4Q6P4Q7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNNM4Q6P4Q7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms