Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP4R4Q6NUP7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP4R4Q6NUP7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP4R4Q6NUP7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP4R4Q6NUP7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP4R4Q6NUP7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP4R4Q6NUP7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP4R4Q6NUP7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R4Q6NUP7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R4Q6NUP7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R4Q6NUP7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R4Q6NUP7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R4Q6NUP7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP4R4Q6NUP7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP4R4Q6NUP7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP4R4Q6NUP7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP4R4Q6NUP7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP4R4Q6NUP7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP4R4Q6NUP7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP4R4Q6NUP7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP4R4Q6NUP7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP4R4Q6NUP7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP4R4Q6NUP7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP4R4Q6NUP7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP4R4Q6NUP7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP4R4Q6NUP7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP4R4Q6NUP7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R4Q6NUP7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R4Q6NUP7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP4R4Q6NUP7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP4R4Q6NUP7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP4R4Q6NUP7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP4R4Q6NUP7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4R4Q6NUP7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4R4Q6NUP7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4R4Q6NUP7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4R4Q6NUP7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4R4Q6NUP7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4R4Q6NUP7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4R4Q6NUP7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4R4Q6NUP7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4R4Q6NUP7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4R4Q6NUP7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4R4Q6NUP7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4R4Q6NUP7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4R4Q6NUP7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4R4Q6NUP7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4R4Q6NUP7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4R4Q6NUP7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4R4Q6NUP7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP4R4Q6NUP7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP4R4Q6NUP7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP4R4Q6NUP7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP4R4Q6NUP7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP4R4Q6NUP7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP4R4Q6NUP7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP4R4Q6NUP7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPP4R4Q6NUP7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R4Q6NUP7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPP4R4Q6NUP7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPP4R4Q6NUP7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPP4R4Q6NUP7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP4R4Q6NUP7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms