Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
RCSD1Q6JBY9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
RCSD1Q6JBY9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
RCSD1Q6JBY9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
RCSD1Q6JBY9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
RCSD1Q6JBY9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
RCSD1Q6JBY9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
RCSD1Q6JBY9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
RCSD1Q6JBY9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
RCSD1Q6JBY9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RCSD1Q6JBY9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RCSD1Q6JBY9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RCSD1Q6JBY9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RCSD1Q6JBY9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RCSD1Q6JBY9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RCSD1Q6JBY9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RCSD1Q6JBY9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RCSD1Q6JBY9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RCSD1Q6JBY9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RCSD1Q6JBY9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
RCSD1Q6JBY9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RCSD1Q6JBY9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RCSD1Q6JBY9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RCSD1Q6JBY9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RCSD1Q6JBY9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
RCSD1Q6JBY9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RCSD1Q6JBY9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RCSD1Q6JBY9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RCSD1Q6JBY9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
RCSD1Q6JBY9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RCSD1Q6JBY9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RCSD1Q6JBY9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RCSD1Q6JBY9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RCSD1Q6JBY9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
RCSD1Q6JBY9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RCSD1Q6JBY9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RCSD1Q6JBY9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RCSD1Q6JBY9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RCSD1Q6JBY9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RCSD1Q6JBY9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RCSD1Q6JBY9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RCSD1Q6JBY9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RCSD1Q6JBY9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RCSD1Q6JBY9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RCSD1Q6JBY9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RCSD1Q6JBY9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RCSD1Q6JBY9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RCSD1Q6JBY9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RCSD1Q6JBY9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
RCSD1Q6JBY9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RCSD1Q6JBY9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RCSD1Q6JBY9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RCSD1Q6JBY9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RCSD1Q6JBY9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RCSD1Q6JBY9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RCSD1Q6JBY9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RCSD1Q6JBY9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RCSD1Q6JBY9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RCSD1Q6JBY9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RCSD1Q6JBY9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RCSD1Q6JBY9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RCSD1Q6JBY9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RCSD1Q6JBY9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RCSD1Q6JBY9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RCSD1Q6JBY9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RCSD1Q6JBY9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RCSD1Q6JBY9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RCSD1Q6JBY9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RCSD1Q6JBY9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RCSD1Q6JBY9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RCSD1Q6JBY9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
RCSD1Q6JBY9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RCSD1Q6JBY9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RCSD1Q6JBY9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RCSD1Q6JBY9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
RCSD1Q6JBY9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RCSD1Q6JBY9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RCSD1Q6JBY9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RCSD1Q6JBY9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RCSD1Q6JBY9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RCSD1Q6JBY9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RCSD1Q6JBY9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RCSD1Q6JBY9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
RCSD1Q6JBY9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RCSD1Q6JBY9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RCSD1Q6JBY9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RCSD1Q6JBY9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RCSD1Q6JBY9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RCSD1Q6JBY9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RCSD1Q6JBY9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RCSD1Q6JBY9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RCSD1Q6JBY9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
RCSD1Q6JBY9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RCSD1Q6JBY9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RCSD1Q6JBY9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RCSD1Q6JBY9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
RCSD1Q6JBY9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RCSD1Q6JBY9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RCSD1Q6JBY9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RCSD1Q6JBY9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms