Protein–RNA interactions for Protein: Q63HM2

PCNX4, Pecanex-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4Q63HM2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCNX4Q63HM2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCNX4Q63HM2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCNX4Q63HM2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCNX4Q63HM2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCNX4Q63HM2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCNX4Q63HM2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCNX4Q63HM2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCNX4Q63HM2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PCNX4Q63HM2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCNX4Q63HM2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCNX4Q63HM2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCNX4Q63HM2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCNX4Q63HM2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCNX4Q63HM2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCNX4Q63HM2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCNX4Q63HM2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCNX4Q63HM2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCNX4Q63HM2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCNX4Q63HM2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCNX4Q63HM2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCNX4Q63HM2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCNX4Q63HM2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCNX4Q63HM2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCNX4Q63HM2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCNX4Q63HM2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCNX4Q63HM2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCNX4Q63HM2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCNX4Q63HM2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCNX4Q63HM2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PCNX4Q63HM2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCNX4Q63HM2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCNX4Q63HM2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCNX4Q63HM2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PCNX4Q63HM2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCNX4Q63HM2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCNX4Q63HM2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCNX4Q63HM2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCNX4Q63HM2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCNX4Q63HM2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCNX4Q63HM2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCNX4Q63HM2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCNX4Q63HM2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCNX4Q63HM2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCNX4Q63HM2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PCNX4Q63HM2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCNX4Q63HM2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCNX4Q63HM2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCNX4Q63HM2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCNX4Q63HM2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PCNX4Q63HM2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCNX4Q63HM2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCNX4Q63HM2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCNX4Q63HM2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCNX4Q63HM2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCNX4Q63HM2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCNX4Q63HM2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCNX4Q63HM2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCNX4Q63HM2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCNX4Q63HM2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCNX4Q63HM2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCNX4Q63HM2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCNX4Q63HM2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCNX4Q63HM2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCNX4Q63HM2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCNX4Q63HM2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCNX4Q63HM2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PCNX4Q63HM2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PCNX4Q63HM2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PCNX4Q63HM2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms