Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GARNL3Q5VVW2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GARNL3Q5VVW2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GARNL3Q5VVW2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GARNL3Q5VVW2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GARNL3Q5VVW2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GARNL3Q5VVW2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GARNL3Q5VVW2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GARNL3Q5VVW2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GARNL3Q5VVW2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GARNL3Q5VVW2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GARNL3Q5VVW2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GARNL3Q5VVW2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GARNL3Q5VVW2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GARNL3Q5VVW2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GARNL3Q5VVW2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GARNL3Q5VVW2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GARNL3Q5VVW2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GARNL3Q5VVW2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GARNL3Q5VVW2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GARNL3Q5VVW2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GARNL3Q5VVW2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GARNL3Q5VVW2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GARNL3Q5VVW2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GARNL3Q5VVW2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GARNL3Q5VVW2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GARNL3Q5VVW2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GARNL3Q5VVW2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GARNL3Q5VVW2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GARNL3Q5VVW2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GARNL3Q5VVW2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GARNL3Q5VVW2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GARNL3Q5VVW2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GARNL3Q5VVW2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GARNL3Q5VVW2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GARNL3Q5VVW2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GARNL3Q5VVW2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GARNL3Q5VVW2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GARNL3Q5VVW2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GARNL3Q5VVW2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GARNL3Q5VVW2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GARNL3Q5VVW2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GARNL3Q5VVW2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GARNL3Q5VVW2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GARNL3Q5VVW2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GARNL3Q5VVW2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GARNL3Q5VVW2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GARNL3Q5VVW2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GARNL3Q5VVW2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GARNL3Q5VVW2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GARNL3Q5VVW2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GARNL3Q5VVW2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GARNL3Q5VVW2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GARNL3Q5VVW2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GARNL3Q5VVW2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GARNL3Q5VVW2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GARNL3Q5VVW2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GARNL3Q5VVW2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GARNL3Q5VVW2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GARNL3Q5VVW2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GARNL3Q5VVW2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GARNL3Q5VVW2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GARNL3Q5VVW2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GARNL3Q5VVW2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GARNL3Q5VVW2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GARNL3Q5VVW2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms