Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVQ6

YOD1, Ubiquitin thioesterase OTU1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YOD1Q5VVQ6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
YOD1Q5VVQ6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
YOD1Q5VVQ6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
YOD1Q5VVQ6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
YOD1Q5VVQ6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
YOD1Q5VVQ6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YOD1Q5VVQ6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
YOD1Q5VVQ6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YOD1Q5VVQ6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
YOD1Q5VVQ6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
YOD1Q5VVQ6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YOD1Q5VVQ6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
YOD1Q5VVQ6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YOD1Q5VVQ6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YOD1Q5VVQ6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YOD1Q5VVQ6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YOD1Q5VVQ6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YOD1Q5VVQ6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YOD1Q5VVQ6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YOD1Q5VVQ6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YOD1Q5VVQ6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YOD1Q5VVQ6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YOD1Q5VVQ6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YOD1Q5VVQ6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YOD1Q5VVQ6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YOD1Q5VVQ6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YOD1Q5VVQ6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YOD1Q5VVQ6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YOD1Q5VVQ6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YOD1Q5VVQ6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
YOD1Q5VVQ6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
YOD1Q5VVQ6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
YOD1Q5VVQ6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
YOD1Q5VVQ6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
YOD1Q5VVQ6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
YOD1Q5VVQ6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
YOD1Q5VVQ6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
YOD1Q5VVQ6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
YOD1Q5VVQ6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
YOD1Q5VVQ6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
YOD1Q5VVQ6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
YOD1Q5VVQ6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
YOD1Q5VVQ6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YOD1Q5VVQ6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YOD1Q5VVQ6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YOD1Q5VVQ6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
YOD1Q5VVQ6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
YOD1Q5VVQ6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YOD1Q5VVQ6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YOD1Q5VVQ6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YOD1Q5VVQ6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YOD1Q5VVQ6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YOD1Q5VVQ6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YOD1Q5VVQ6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
YOD1Q5VVQ6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YOD1Q5VVQ6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YOD1Q5VVQ6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YOD1Q5VVQ6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YOD1Q5VVQ6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YOD1Q5VVQ6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YOD1Q5VVQ6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YOD1Q5VVQ6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YOD1Q5VVQ6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YOD1Q5VVQ6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YOD1Q5VVQ6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YOD1Q5VVQ6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YOD1Q5VVQ6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YOD1Q5VVQ6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YOD1Q5VVQ6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YOD1Q5VVQ6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YOD1Q5VVQ6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms