Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SFMBT2Q5VUG0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SFMBT2Q5VUG0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SFMBT2Q5VUG0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SFMBT2Q5VUG0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SFMBT2Q5VUG0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SFMBT2Q5VUG0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SFMBT2Q5VUG0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SFMBT2Q5VUG0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SFMBT2Q5VUG0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SFMBT2Q5VUG0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SFMBT2Q5VUG0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SFMBT2Q5VUG0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SFMBT2Q5VUG0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SFMBT2Q5VUG0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SFMBT2Q5VUG0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SFMBT2Q5VUG0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SFMBT2Q5VUG0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SFMBT2Q5VUG0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SFMBT2Q5VUG0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SFMBT2Q5VUG0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SFMBT2Q5VUG0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SFMBT2Q5VUG0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SFMBT2Q5VUG0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SFMBT2Q5VUG0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SFMBT2Q5VUG0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SFMBT2Q5VUG0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SFMBT2Q5VUG0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SFMBT2Q5VUG0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SFMBT2Q5VUG0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SFMBT2Q5VUG0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SFMBT2Q5VUG0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SFMBT2Q5VUG0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SFMBT2Q5VUG0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SFMBT2Q5VUG0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SFMBT2Q5VUG0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
SFMBT2Q5VUG0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SFMBT2Q5VUG0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SFMBT2Q5VUG0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SFMBT2Q5VUG0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SFMBT2Q5VUG0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SFMBT2Q5VUG0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SFMBT2Q5VUG0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SFMBT2Q5VUG0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SFMBT2Q5VUG0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SFMBT2Q5VUG0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SFMBT2Q5VUG0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SFMBT2Q5VUG0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SFMBT2Q5VUG0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SFMBT2Q5VUG0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SFMBT2Q5VUG0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SFMBT2Q5VUG0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SFMBT2Q5VUG0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SFMBT2Q5VUG0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SFMBT2Q5VUG0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SFMBT2Q5VUG0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SFMBT2Q5VUG0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SFMBT2Q5VUG0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SFMBT2Q5VUG0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SFMBT2Q5VUG0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SFMBT2Q5VUG0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SFMBT2Q5VUG0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SFMBT2Q5VUG0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SFMBT2Q5VUG0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SFMBT2Q5VUG0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SFMBT2Q5VUG0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SFMBT2Q5VUG0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SFMBT2Q5VUG0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SFMBT2Q5VUG0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SFMBT2Q5VUG0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SFMBT2Q5VUG0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SFMBT2Q5VUG0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SFMBT2Q5VUG0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SFMBT2Q5VUG0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SFMBT2Q5VUG0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SFMBT2Q5VUG0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SFMBT2Q5VUG0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SFMBT2Q5VUG0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SFMBT2Q5VUG0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SFMBT2Q5VUG0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SFMBT2Q5VUG0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SFMBT2Q5VUG0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SFMBT2Q5VUG0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SFMBT2Q5VUG0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SFMBT2Q5VUG0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SFMBT2Q5VUG0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SFMBT2Q5VUG0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SFMBT2Q5VUG0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SFMBT2Q5VUG0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SFMBT2Q5VUG0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SFMBT2Q5VUG0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SFMBT2Q5VUG0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SFMBT2Q5VUG0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SFMBT2Q5VUG0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SFMBT2Q5VUG0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SFMBT2Q5VUG0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SFMBT2Q5VUG0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SFMBT2Q5VUG0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SFMBT2Q5VUG0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SFMBT2Q5VUG0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms