Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF648Q5T619 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF648Q5T619 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF648Q5T619 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF648Q5T619 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF648Q5T619 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF648Q5T619 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF648Q5T619 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF648Q5T619 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF648Q5T619 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF648Q5T619 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF648Q5T619 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZNF648Q5T619 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF648Q5T619 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF648Q5T619 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF648Q5T619 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF648Q5T619 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF648Q5T619 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF648Q5T619 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF648Q5T619 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF648Q5T619 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF648Q5T619 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF648Q5T619 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF648Q5T619 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF648Q5T619 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF648Q5T619 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF648Q5T619 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF648Q5T619 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF648Q5T619 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF648Q5T619 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF648Q5T619 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF648Q5T619 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF648Q5T619 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF648Q5T619 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF648Q5T619 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF648Q5T619 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF648Q5T619 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF648Q5T619 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF648Q5T619 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF648Q5T619 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF648Q5T619 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF648Q5T619 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF648Q5T619 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF648Q5T619 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF648Q5T619 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF648Q5T619 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF648Q5T619 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF648Q5T619 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF648Q5T619 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF648Q5T619 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF648Q5T619 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF648Q5T619 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms