Protein–RNA interactions for Protein: Q5T442

GJC2, Gap junction gamma-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC2Q5T442 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJC2Q5T442 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJC2Q5T442 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
GJC2Q5T442 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJC2Q5T442 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJC2Q5T442 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GJC2Q5T442 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GJC2Q5T442 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GJC2Q5T442 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GJC2Q5T442 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GJC2Q5T442 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJC2Q5T442 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJC2Q5T442 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
GJC2Q5T442 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GJC2Q5T442 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GJC2Q5T442 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GJC2Q5T442 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GJC2Q5T442 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GJC2Q5T442 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GJC2Q5T442 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GJC2Q5T442 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJC2Q5T442 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GJC2Q5T442 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GJC2Q5T442 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GJC2Q5T442 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GJC2Q5T442 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GJC2Q5T442 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
GJC2Q5T442 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
GJC2Q5T442 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJC2Q5T442 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJC2Q5T442 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJC2Q5T442 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJC2Q5T442 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJC2Q5T442 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GJC2Q5T442 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GJC2Q5T442 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GJC2Q5T442 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GJC2Q5T442 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJC2Q5T442 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJC2Q5T442 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJC2Q5T442 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJC2Q5T442 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJC2Q5T442 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJC2Q5T442 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJC2Q5T442 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GJC2Q5T442 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GJC2Q5T442 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
GJC2Q5T442 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GJC2Q5T442 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GJC2Q5T442 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GJC2Q5T442 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
GJC2Q5T442 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GJC2Q5T442 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GJC2Q5T442 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GJC2Q5T442 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GJC2Q5T442 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GJC2Q5T442 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJC2Q5T442 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJC2Q5T442 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJC2Q5T442 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJC2Q5T442 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJC2Q5T442 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJC2Q5T442 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJC2Q5T442 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJC2Q5T442 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJC2Q5T442 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJC2Q5T442 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJC2Q5T442 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJC2Q5T442 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJC2Q5T442 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJC2Q5T442 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJC2Q5T442 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJC2Q5T442 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GJC2Q5T442 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJC2Q5T442 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJC2Q5T442 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJC2Q5T442 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJC2Q5T442 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJC2Q5T442 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29■■■□□ 2.23
GJC2Q5T442 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJC2Q5T442 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJC2Q5T442 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJC2Q5T442 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJC2Q5T442 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJC2Q5T442 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GJC2Q5T442 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GJC2Q5T442 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GJC2Q5T442 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GJC2Q5T442 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GJC2Q5T442 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GJC2Q5T442 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJC2Q5T442 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJC2Q5T442 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJC2Q5T442 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
GJC2Q5T442 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
GJC2Q5T442 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJC2Q5T442 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJC2Q5T442 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJC2Q5T442 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJC2Q5T442 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms